上交大硕士申请东京大学博士

公费的博士是指奖学金项目吧？

目前的奖学金项目包括：日本文部科学省国费奖学金项目、国家建设高水平大学奖学金项目。你应该都具备申请资格。

关于这两种奖学金的申请，国家留学基金委网站有详细的说明。你所就读的大学的国际交流处也有人负责此事。