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2016-11-04 19054人看过
NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美国国立生物技术信息中心。理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表,出现了生命过程的语法,其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性,并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具,以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。在生物学研究中,NCBI提供了大量的生物信息分析工具以及文献。所以学号检索方法是进入新生物学领域的必备技能。Blast工具、PubMed文献数据库等。
工具/原料
浏览器 NCBI网址
方法/步骤
1/9 分步阅读
首先进入NCBI主页。
Map view演示,主要是找到相关基因在染色体上的位置,以人类IL-6基因为例。
点击Map View
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选择物种,点击Go;
设置filter,过滤信息;
点击Genes seq查询序列
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最后进入序列下载页面,可以直接下载。可以选择多种格式,一般选择fasta。
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通过clone查询相关基因的cDNA序列
选择clone数据库,search基因描述。
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对基因的蛋白质序列和mRNA查询。
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也可对序列进行查询。基因组展示。
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也可以查询序列信息。
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查询已知引物,通过probe数据库搜索。
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同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式,排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。
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注意事项
简单演示仍需深入了解
21世纪是生物科学的世纪
软件 NCBI
编辑于2016-11-04,内容仅供参考并受版权保护
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bsci认证机构哪家好?
NCBI无法查询蛋白质等电点,可以到swissprot查询。
这个NCBI没有相关的功能,这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,可以到swissprot进行查询,查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。
另外NCBI开发有Genbank等公共数据库,提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具,可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析。
扩展资料:
NCBI开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。NCBI支持与推广多种医学及科技方面的数据库,如:三维蛋白质结构的分子模型数据库(MMDB)、孟德尔人类遗传(OMIM)等。
另外使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。可以进入NCBI后选择ConservedDomain中的Search。
除此之外这个网站Search的黄色部分其中CD-search只能提交单条序列,BatchCD-Search可以上传多条序列,里面收录的数据范围是比较广的,可以利用NCBI进行检索。
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