R批量读取、处理及写出文件

在对同一路径下多个文件此链运做相同处理时，可以循环读取文件夹中的文件，批森梁量读取，处理和写入文件，会大大提高工作效率，在R语言中，处理方法如下所示。

上面唤局多个文件被读入到一个叫data的list的文件中，下面可以通过data[[]]来取出每一个文件来进行相同的处理。

下面是对ensembl id注释成gene symbol的例子

每个需要处理的文件为：

注释文件：

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参考：

https://blog.csdn.net/u011596455/article/details/79601113

用C语言实现文件读写 *** 作

二、直接I/O文件 *** 作

这是C提供的另一种文件 *** 作，它是通过直接存/取文件来完成对文件的处理，而上篇所说流式文件 *** 作是通过缓冲区来进行流式文件 *** 作是围绕一个 FILE指针来进行，而此类文件 *** 作是围绕一个文件的“句柄”来进行，什么是句柄呢?它是一个整数，是系统用来标识一个文件(在WINDOWS中，句柄的概念扩展到所有设备资源的标识)的唯一的记号。此类文件 *** 作常用的函数如下表，这些函数及其所用的一些符号在io.h和fcntl.h中定义，在使用时要加入相应的头文件。

函数 说明

open() 打开一个文件并返回它的句柄

close() 关链渣闭一个句柄

lseek() 定位到文件的指定位置

read() 块读文件

write() 块写文件

eof() 测试文件是否结束

filelength() 取得文件长度

rename() 重命名文件

chsize() 改变文件长度

下面就对这些函数一一说明：

1.open()

打开一个文件并返回它的句柄，如果失败，将返回一个小于0的值，原型是int open(const char *path, int access [, unsigned mode])参数path是要打手橘开的文件名，access是打开的模式，mode是可选项。表示文件的属性，主要用于UNIX系统中，在DOS/WINDOWS这个参数没有意义。其中文件的打开模式如下表。

符号 含义 符号 含义 符号 含义

O_RDONLY 只读方式 O_WRONLY 只写方式 O_RDWR 读/写方式

O_NDELAY 用于UNIX系统 O_APPEND 追加方式 O_CREAT 如果文件不存在就创建

O_TRUNC 把文件长度截为0 O_EXCL 和O_CREAT连用，如果文件存在返回错误 O_BINARY 二进制方式

O_TEXT 文本方式

对于多个要求，可以用"|"运算符来连接，如O_APPEND|O_TEXT表示以文本模式和追加方式打开文件。

例：int handle=open("c:\\msdos.sys",O_BINARY|O_CREAT|O_WRITE)

2.close()

关闭一个句柄，原型是int close(int handle)如果成功返棚薯悄回0

例：close(handle)

3.lseek()

定位到指定的位置，原型是：long lseek(int handle, long offset, int fromwhere)参数offset是移动的量，fromwhere是移动的基准位置，取值和前面讲的fseek()一样，SEEK_SET：文件首部SEEK_CUR：文件当前位置SEEK_END：文件尾。此函数返回执行后文件新的存取位置。

例：

lseek(handle,-1234L,SEEK_CUR)//把存取位置从当前位置向前移动1234个字节。

x=lseek(hnd1,0L,SEEK_END)//把存取位置移动到文件尾，x=文件尾的位置即文件长度

4.read()

从文件读取一块，原型是int read(int handle, void *buf, unsigned len)参数buf保存读出的数据，len是读取的字节。函数返回实际读出的字节。

例：char x[200]read(hnd1,x,200)

5.write()

写一块数据到文件中，原型是int write(int handle, void *buf, unsigned len)参数的含义同read()，返回实际写入的字节。

例：char x[]="I Love You"write(handle,x,strlen(x))

7.eof()

类似feof()，测试文件是否结束，是返回1，否则返回0原型是：int eof(int handle)

例：while(!eof(handle1)){……}

8.filelength()

返回文件长度，原型是long filelength(int handle)相当于lseek(handle,0L,SEEK_END)

例：long x=filelength(handle)

9.rename()

重命名文件，原型是int rename(const char *oldname, const char *newname)参数oldname是旧文件名，newname是新文件名。成功返回0

例：rename("c:\\config.sys","c:\\config.w40")

10.chsize()

改变文件长度，原型是int chsize(int handle, long size)参数size表示文件新的长度，成功返回0，否则返回-1，如果指定的长度小于文件长度，则文件被截短如果指定的长度大于文件长度，则在文件后面补''\0''。

例：chsize(handle,0x12345)

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