在用gzip的时候,要解压缩则要加入参数-d一定要保证解压缩的文件是完整的、无损坏的(如果是解压数据,数据不完整,是会报错的)
另外,要提取fastq文件要4行4行的取,截取前400行
解压缩命令:
命令格式:tar -zxvf 压缩文件名.tar.gz。解压缩后的文件只能放在当前的目录。
解压全部命令参考:
tar _xvf file.tar 解压 tar包
tar -xzvf file.tar.gz 解压tar.gz
tar -xjvf file.tar.bz2 解压 tar.bz2
tar _xZvf file.tar.Z 解压tar.Z
unrar e file.rar 解压rar
unzip file.zip 解压zip
linux下解压命令大全
.tar
解包:tar xvf FileName.tar
打包:tar cvf FileName.tar DirName
(注:tar是打包,不是压缩!)
———————————————
.gz
解压1:gunzip FileName.gz
解压2:gzip -d FileName.gz
压缩:gzip FileName
.tar.gz 和 .tgz
解压:tar zxvf FileName.tar.gz
压缩:tar zcvf FileName.tar.gz DirName
———————————————
.bz2
解压1:bzip2 -d FileName.bz2
解压2:bunzip2 FileName.bz2
压缩: bzip2 -z FileName
.tar.bz2
解压:tar jxvf FileName.tar.bz2
压缩:tar jcvf FileName.tar.bz2 DirName
———————————————
.bz
解压1:bzip2 -d FileName.bz
解压2:bunzip2 FileName.bz
压缩:未知
.tar.bz
解压:tar jxvf FileName.tar.bz
压缩:未知
———————————————
.Z
解压:uncompress FileName.Z
压缩:compress FileName
tar.Z
解压:tar Zxvf FileName.tar.Z
压缩:tar Zcvf FileName.tar.Z DirName
———————————————
.zip
解压:unzip FileName.zip
压缩:zip FileName.zip DirName
———————————————
.rar
解压:rar x FileName.rar
压缩:rar a FileName.rar DirName
———————————————
.lha
解压:lha -e FileName.lha
压缩:lha -a FileName.lha FileName
———————————————
.rpm
解包:rpm2cpio FileName.rpm | cpio -div
———————————————
.deb
解包:ar p FileName.deb data.tar.gz | tar zxf -
———————————————
.tar .tgz .tar.gz .tar.Z .tar.bz .tar.bz2 .zip .cpio .rpm .deb .slp .arj .rar .ace .lha .lzh .lzx .lzs .arc .sda .sfx .lnx .zoo .cab .kar .cpt .pit .sit .sea
解压:sEx x FileName.*
压缩:sEx a FileName.* FileName
sEx只是调用相关程序,本身并无压缩、解压功能,请注意!
gzip 命令
减少文件大小有两个明显的好处,一是可以减少存储空间,二是通过网络传输文件时,可以减少传输的时间。gzip 是在 Linux 系统中经常使用的一个对文件进行压缩和解压缩的命令,既方便又好用。
语法:gzip [选项] 压缩(解压缩)的文件名该命令的各选项含义如下:
-c 将输出写到标准输出上,并保留原有文件。-d 将压缩文件解压。-l 对每个压缩文件,显示下列字段: 压缩文件的大小;未压缩文件的大小;压缩比;未压缩文件的名字-r 递归式地查找指定目录并压缩其中的所有文件或者是解压缩。-t 测试,检查压缩文件是否完整。-v 对每一个压缩和解压的文件,显示文件名和压缩比。-num 用指定的数字 num 调整压缩的速度,-1 或 --fast 表示最快压缩方法(低压缩比),-9 或--best表示最慢压缩方法(高压缩比)。系统缺省值为 6。指令实例:
gzip *% 把当前目录下的每个文件压缩成 .gz 文件。gzip -dv *% 把当前目录下每个压缩的文件解压,并列出详细的信息。gzip -l *% 详细显示例1中每个压缩的文件的信息,并不解压。gzip usr.tar% 压缩 tar 备份文件 usr.tar,此时压缩文件的扩展名为.tar.gz。
在Linux下,可以使用gzip工具将文件压缩成gz文件。下面是具体的步骤:
打开终端,进入要压缩的文件所在的目录。
运行以下命令进行压缩:
gzip 文件名
其中,文件名为要压缩的文件名,可以是绝对路径或相对路径。
例如,要将文件test.txt压缩成test.txt.gz,可以运行以下命令:
gzip test.txt
压缩完成后,原文件会被删除,只剩下压缩后的文件。如果不想删除原文件,可以使用以下命令进行压缩:
gzip -c 文件名 >文件名.gz
其中,-c选项表示将压缩后的数据输出到标准输出,>表示重定向输出到一个文件中。这样,压缩后的文件名为文件名.gz,原文件不会被删除。
例如,要将文件test.txt压缩成test.txt.gz,但不删除原文件,可以运行以下命令:
gzip -c test.txt >test.txt.gz
压缩完成后,可以使用gunzip命令解压缩gz文件,例如:
gunzip 文件名.gz
其中,文件名为要解压缩的gz文件名,解压缩后会生成一个同名的文件,去除.gz后缀。
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