MPI并行计算for循环

MPI并行计算for循环,第1张

你的想法很独特,比如for(i=0;i<15;i++){},如果你确定这15次都要做,并且他们的执行顺序无所谓,并且他们都很慢并行能大大提高效率,那可以把i=014作为15个任务下发,用线程池去处理

MPI(message passing interface),是一个消息传递接口。MPI的函数总共有287个。

想实现一个MPI并行计算的程序的话,只要掌握MPI的工作机理和6个简单的MPI函数便可以了,本文介绍4个简单MPI函数:MPI_INIT、MPI_COMM_RANK、MPI_COMM_SIZE和MPI_FINALIZE。

注意:以下调用格式为Fortran格式,大部分教程都是C语言的MPI介绍,这里以及以后的文章都是以Fortran为基础,尤其要注意Fortran不分大小写。

先给出一个最简单的Hello_world的Fortran + MPI的程序,在此基础上来分析MPI的4个最简单的函数——MPI_INIT、MPI_COMM_RANK、MPI_COMM_SIZE和MPI_FINALIZE。

MPI_Init用来初始化MPI执行环境,建立多个MPI进程之间的联系,为后续通信做准备。

MPI_Finalize则是结束MPI执行环境。

MPI_Comm_rank就是来标识各个MPI进程的,告诉调用该函数的进程“我是谁?”。

MPI_COMM_SIZE用来标识相应进程组中有多少个进程。

21 将以上内容保存为hello_worldf90,上传到服务器的文件夹/home/xldeng/mpi里面:

22 编译hello_worldf90为hello_world,并用ls查看内容:

23 使用服务器里面的命令来调用不同的节点上面的核来计算:

31 注意程序中的一个小细节:

含义为调用mpi的库函数,因为使用的是Intel MPI + Fortran90,所以调用的方式为:use mpi。Fortran77可能需要 include "mpifh"。

32 在22节中的mpiifort是ifort的并行使用方法,检验mpiifort的用法:which mpiifort或者是mpiifort -v。

33 在23节中的说明:本程序的运行平台为服务器上,所以使用的是 MPI使用指南 | 武汉大学超算中心 中提供的提交方法。如果在单台服务器上面,可以使用如下命令:

来运行程序。

OpenMP和MPI是并行编程的两个手段,对比如下:

OpenMP:线程级(并行粒度);共享存储;隐式(数据分配方式);可扩展性差。

MPI:进程级;分布式存储;显式;可扩展性好。OpenMP采用共享存储,意味着它只适应于SMP,DSM机器,不适合于集群。MPI虽适合于各种机器,但它的编程模型复杂。

需要分析及划分应用程序问题,并将问题映射到分布式进程集合。需要解决通信延迟大和负载不平衡两个主要问题。

延伸论述:

我认为,要理解OpenMP和MPI,首先要有一些 *** 作系统知识和系统编程基础——OpenMP对应的实际上是单进程多线程的并发编程模型,可以将一个单线程的程序按for循环拆分成多线程——相当于pthread_create。

对于同一个进程的多个线程来说,由于它们只是独占自己的栈内存,堆内存是共享的,因此数据交换十分地容易,直接通过共享变量就可以进行交换,编程模型非常简单易用,并且对于 *** 作系统来说,线程的上下文切换成本也比进程低很多。

然而另一方面,由于线程不能脱离进程独立存在,而一个进程不能存在于多台机器上,所以OpenMP只适用于拥有多个CPU核心的单台电脑。并且多线程编程存在临界区(Critical Section),需要你自己去加锁,解决Race Condition问题,否则的话很容易导致不可预知的后果。

而MPI则是多进程的并发编程模型,相当于你自己调用fork——每一个进程的内存地址空间都是独立的,它们彼此之间几乎什么都不共享,只能通过进程间通信(IPC)来交换彼此的数据,因此编程难度明显要大很多。

MPI有一个非常显著的优点,那就是对于一个分布式系统来说,进程是可以在分布式系统的每一台电脑之间转移的,因此对于拥有多台电脑的分布式系统来说,其并发性要明显好于OpenMP。

以上就是关于MPI并行计算for循环全部的内容,包括:MPI并行计算for循环、【Fortran并行科学计算】——Hello World程序、从并行计算的角度对比,MPI 与 OpenMP 有什么区别等相关内容解答,如果想了解更多相关内容,可以关注我们,你们的支持是我们更新的动力!

欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出

原文地址: http://outofmemory.cn/zz/9338389.html

(0)
打赏 微信扫一扫 微信扫一扫 支付宝扫一扫 支付宝扫一扫
上一篇 2023-04-27
下一篇 2023-04-27

发表评论

登录后才能评论

评论列表(0条)

保存