imagej加标尺后怎么保存

1、首先，使用imageJ在生物学图片后期处理中功能。

2、其次，在打开的窗口中设置knowndistance为标尺长度。

3、最后，得到的length既是换算后的长度，点击保存即可。

1. 关键：用矩形框住calibration bar后，右键duplicate

1. 主要步骤

I、先在recon image中生成一个合适大小的矩形roi（最好用macro生成）

一般使改roi垂直居中

I、Analyze->Tools->Calibration bar

在d出的对话框的location选择At selection，不要勾选overlay(否则会破坏原图像)，设置合适的Number of labels（一般为3）和decimal（如果有小数，则设为0）。

II、这时会生成一幅RGB格式的包含Calibration bar的新图片

如果只需要灰度图像，则这时将图像格式改为灰度。

III、生成一幅与原图像等高的独立calibration bar图片

用macro(setpixel函数)把calibration bar矩形的上下的像素全改为白色，然后选一个与原图像等高的包含calibration bar的矩形roi，右键duplicate。

方法2：只框住calibration bar，右键duplicate。然后在PS中新建一个与原图像等高，calibration bar等宽的新图像，将calibration bar居中嵌入。注意，RGB格式的图像应设为8位，否则无法保存为eps格式。

2. Macro:recon指标尺，cali_bar_macro.txt

pixSize=256whitePixelVal=255

xStart=200width=57height=148

yStart=(pixSize-height)/2

xEnd=xStart+widthyEnd=(pixSize+height)/2

makeRectangle(xStart, yStart, width, height)

run("Calibration Bar...", "location=[At Selection] fill=White label=Black //number=3 decimal=0 font=12 zoom=1")

run("32-bit")//change RGB to gray image

run("In [+]")

for(yInd=0yInd<pixSizeyInd++)

{

for(xInd=xStartxInd<pixSizexInd++)

{

if(yInd<=yStart || yInd >=yEnd)

setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal)

}

}

makeRectangle(xStart, 0, width-3, pixSize)

run("Duplicate...", " ")

3. Macro:bias指标尺bias_cali_bar_macro.txt

//Cali bar locates at the center

//size of cali image  is 256 /times 256

pixSize=256whitePixelVal=255

width=57height=148

xStart=(pixSize-width)/2yStart=(pixSize-height)/2

xEnd=xStart+widthyEnd=(pixSize+height)/2

makeRectangle(xStart, yStart, width-3, height)

run("Calibration Bar...", "location=[At Selection] fill=White label=Black //number=5 decimal=1 font=12 zoom=1")

run("32-bit")//change RGB to gray image

run("In [+]")

for(yInd=0yInd<pixSizeyInd++)

{

for(xInd=xStartxInd<xEndxInd++)

{

if(yInd<=yStart || yInd >=yEnd)

setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal)

}

for(xInd=0xInd<xStartxInd++)

{

setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal)

}

for(xInd=xEndxInd<pixSizexInd++)

{

setPixel(xInd, yInd, whitePixelVal)

}

}

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