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全国排名1.清华大学，2.华中科技大学，3.西安交通大学，4.上海交通大学，5.浙江大学，6.西安电子科技大学，7.武汉大学，8.复旦大学，9.哈尔滨工业大学，10.东北大学，11.北京大学，12.东南大学，13.北京航空航天大学，14.中国科学技术大学，15.电子科技大学，16.吉林大学，17.南京理工大学，18.重庆大学，19.北京科技大学，20.同济大学。
全国37所国家级示范性软件学院上海有四所，复旦大学是其中之一，剩下三所是交通大学、同济大学、华东师范大学。
复旦大学软件工程硕士（MSE）以市场为导向：在课程设置、教学内容、培养方式、师资建设以及教务和学生管理制度等方面，更加突出市场的导向作用。即市场对于软件人才的要求和软件人才对于教育的需求。特别是，深入行业部门，发展面向行业的人才培养。
个性化的教育服务：实行完全学分制，d性学制，以满足学生多层次、多方面、个性化的需求。学生在2—4年内，自主选课，修满12门课（36学分），完成学位论文（4学分）且通过论文答辩，授予工程硕士专业学位。
学院软件工程硕士培养以特色方向建设与单位定向委培相结合为重点,先后为花旗软件、微软、申银万国、公安部十一局、徐汇区软件联盟等各类企事业单位培养了大批人才，成为中高端复合型软件人才成长的助推器。