高斯09找过渡态的关键是什么，用高斯View05 作图

Gaussian09优化过渡态需要的初始构型是根据你设计的反应途径猜测的。如果你需要得到 “甲基自由基与臭氧的反应” 的过渡态，你设计的反应是甲基夺取臭氧中的一个氧原子，还是甲基结合到臭氧上，这两个途径的过渡态是不同的。

如果你希望甲基夺取臭氧上的一个氧原子，你需要将被夺取的氧原子与甲基的碳原子接近，同时让这个被夺取的氧原子远离原臭氧的结构。也就是说，一个氧原子处于甲基和氧分子之间。

H3C....O....O2 大概是这个样子吧，原子间的距离需要多调试几次。

先用 MP2/6-31G(d) opt(ts,calcfc,maxcyc=200,nosymm) freq=noraman 试试。

只有在做热力学校正时，默认温度才是室温(298K)和一个大气压。首先你要明白，一个结构构型对应一个能量，此为分子势能，这个与温度无关。温度有什么作用呢？有了温度，就使得分子可以动起来，访问不同的构型，即温度是一种推动力，推动分子呈现不同的结构，在最小势能结构附近波动。温度越高，波动越大，即能够呈现的高能结构越多。这时候，你的分子的除势能外，还要考虑动能，并且由于构型增多，势能也不再是0K下的最低势能，这就是热力学，在热的作用下，体系能量随温度、压力变化的规律。 熵变ΔS呢，是把分子处理成刚性转子、平动子、谐振子来近似估算状态数在不同温度下的变化，所以，热力学校正一定要做频率计算。因为频率计算就是计算有多少个谐振模式、谐振频率多少。ChemiAndy(站内联系TA)为什么要取298k和一个大气压呢，这在物理化学上叫标准状态，绝大多数实验热力学数据是转化到标准状态进行比较的。也有例外，Gauss计算中你可以改变默认温度。飞行鸟(站内联系TA)高斯默认的温度为298.15K，默认压强为 1atm。但是可以修改温度的。

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