如何利用MS搭建晶胞结构

如何利用MS搭建晶胞结构,第1张

对于很多结构,我们比较容易获得其六角晶胞的结构数据,因为六角晶胞一般是原胞,包括最少的周期性原子,但在实际计算中,立方晶胞会更方便。比如在lammps中,如果采用六角晶胞,在计算d性常数的时候,时常会报下面的错误:ERROR: Triclinic box skew is too large (domain.cpp:151)这是对六角晶胞进行形变,使得盒子的倾斜量超过了基矢的1/2而产生的结果。我不知道是否可以通过lammps命令设置得到解决,但却可以通过将六角晶胞换成立方晶胞得到有效解决。

在MS上file-->import-->structure-->metal oxide-->SiO2的晶体结构后,build->build nanostructure

这个可以参见“中科大materials studioppt教程5”,里面更详细。这篇文章原本用的是NaCl为例,但因为转载自百度博客,在新浪这边显示不了图片,我这里就改做我现在做的Ti3SiC2为例,简单说说怎么利用MS建晶体结构。 有疑问可联系[email protected]或直接评论本文。1、启动materialsstudio时会提示:create a new project or open an existing project在这里选择create a newproject,然后会出现的窗口选择new project保存的目录和名称,如果不清楚,这里都选择默认即可。2、在project窗口内,untitled右键new/3D atomisticDocument.xsd,以建立保存材料结构模型的文件,在所打开的文件窗口可以建立、编辑所建立的各种模型这是所有计算的前提;3、然后在菜单栏build/crystals/build crystal4、出现的buildcrystal窗口中有三个标签,第一个是选择晶体所在的空间群space group,以Ti3SiC2晶体为例空间群为P63/mmc,可以通过下拉菜单找到这个群,也可以直接输入这个空间群的编号194,在第二个标签latticeparameters中填写晶格常数,由于是立方晶系只需填一个length a和c;完成后选择build将回到原3D窗口将看到一个晶格框架;5、通过工具栏或者build/add atom出现添加原子窗口,首先添加Ti1,坐标a、b、c为0,再添加Si原子a、b、c坐标为(0,0,0.25),再依次添加Ti2(0.333,0.666,0.142)和C(0.666,0.333,0.070)原子(这里是大概的位置,更准确的位置可通过优化晶体几何结构得到),晶体就建立起来了 。6、在3D模型文件窗口右键出现的菜单选择displaystyle窗口选择显示模式,选择CPK7、这时候的晶体模型中原胞外也存在原子,可通过Build/crystal/rebuild crystal 按rebuild即可去除。8、可右击选label,在label选项框右边选中ElementSymbol,然后按Apply,即可在原子上显示原子符号。7、完成后晶体模型为


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