python – 如何在多索引pandas数据帧中选择嵌套列

概述我创建了一个像这样的3D Pandas数据帧： A= ['ECFP', 'ECFP', 'ECFP', 'FCFP', 'FCFP', 'FCFP', 'RDK5', 'RDK5', 'RDK5']B = ['R', 'tau', 'RMSEc', 'R', 'tau', 'RMSEc', 'R', 'tau', 'RMSEc']C = array([[ 0.1 , 0.3 , 0. 我创建了一个像这样的3D Pandas数据帧：

A=  ['ECFP','ECFP','FCFP','RDK5','RDK5']B = ['R','tau','RMSEc','R','RMSEc']C = array([[ 0.1,0.3,0.5,nan,0.6,0.4 ],[ 0.4,0.4,0.3 ],[ 1.2,1.3,1.1,1.5,1.  ],0.8,0.1,0.2 ],[ 0.2,0.6 ],[ 1.,1.2,1.,0.9,0.7,[ 0.6,0.5 ],0.97,1.  ]])df = pd.DataFrame(data=C.T,columns=pd.MultiIndex.from_tuples(zip(A,B)))df = df.dropna(axis=0,how='any')

最终的Dataframe如下所示：

ECFP            FCFP            RDK5                R  tau RMSEc    R  tau RMSEc    R  tau RMSEc0  0.1  0.4   1.2  0.4  0.2   1.0  0.4  0.6   1.21  0.3  0.3   1.3  0.3  0.3   1.2  0.7  0.5   1.52  0.5  0.3   1.1  0.4  0.3   1.0  0.5  0.3   1.34  0.6  0.4   1.5  0.1  0.5   1.2  0.6  0.3   1.55  0.4  0.3   1.0  0.2  0.6   1.0  0.6  0.5   1.0

如何才能在所有类型的数据(‘ECFP’,’FCFP’,’RDK5′)的’R’值之间获得相关矩阵？

解决方法 使用 IndexSlice：

In [53]: df.loc[:,pd.IndexSlice[:,'R']]Out[53]:  ECFP FCFP RDK5     R    R    R0  0.1  0.4  0.41  0.3  0.3  0.72  0.5  0.4  0.54  0.6  0.1  0.65  0.4  0.2  0.6

总结

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