1)反义lncRNA(antisense lncRNA),由邻近的编码基因反方向转录,与其他蛋白质编码基因存在重叠区域(如共享外显子);
2)基因内lncRNA(intronic lncRNA),起始于蛋白质编码基因的内含子,但与其无重叠区域,由相对邻近的蛋白质编码基因从任意方向转录;
3)异质性lncRNA(divergent lncRNA),由邻近的蛋白质编码基因的启动子反方向转录,转录启动时常伴随相邻蛋白质编码基因转录起始位点数百bp的转录;
4)基因间lncRNA(intergenic lncRNA),由蛋白质编码基因及那些不共享启动子、外显子或内含子的蛋白质编码基因共转录而来;
5)增强子式lncRNA(enhancer lncRNA),由增强子转录,可长距离或短距离介导调控转录lncRNA自身的增强子与基因组内其它转录因子间的相互作用。
1)基因表达调控
2)调节组蛋白修饰与染色质重塑
3)调节组蛋白修饰与染色质重塑
参考:
1) http://html.rhhz.net/ZGSWGCZZ/html/20160908.htm#zz
2) http://www.ajsmmu.cn/ajsmmu/ch/reader/create_pdf.aspx?file_no=20100539&flag=1&year_id=2011&quarter_id=7
常用的有microRNA数据库miRBasePDB、NDB数据库,tRNA数据库,以及你想要的其他种类的RNA数据库。
其中PDB、NDB数据库比较权威,可靠性较高,也比较全面
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