三大核酸数据库的特点

三大核酸数据库的特点,第1张

三大核酸数据库的特点分别是:

1、Genome收录的物种涉及所有的生物领域:细菌、古细菌、真核生物,以及许多病毒、噬菌体、类病毒、质粒以及含有遗传物质的细胞器。

2、Gene数据库收录全部已测序物种的基因注释信息,包括基因的名称、染色体定位、基因序列和编码产物(mRNA、蛋白质)情况、基因功能和相关文献信息等,并与GenBank、OMIM、遗传多态数据库(如dbSNP、dbVar)等NCBI子库,及KEGG、GeneOntology等外源性数据库进行交叉引用。

3、GenBank是NIH遗传序列数据库,集成了所有公开可获得的已注释DNA序列,其收录的核酸序列数据根据不同的研究属性,分属于Nucleotide、GSS和EST三个子库。

已知蛋白质

可应用X射线晶体衍射法测定其三维空间结构

利用核磁共振法了解其构象

DNA和蛋白质测序技术

可测定其一级结构、也就是你所说的核酸序列

至于 知道蛋白质名字 找到核算序列

只能是别人 测过的

用Nucleotide数据库搜索

或者是 你知道了氨基酸序列

可通过密码子对应表知道核酸序列

起始密码子:甲硫氨酸AUG 缬氨酸GUG

终止密码子:UAA UGA UAG

简单的用C读取文件的例子代码片段。

... ...

FILE *fp

char buffer[1000]

fp=fopen( "input.txt", "r" )

while ( fread(&buffer, sizeof(buffer), 1, fp )==1)

{

... ...

//对从文件读出来的数据在此处进行处理

... ...

}

fclose(fp)


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原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/10044795.html

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