求助,如何查找细菌的全基因组序列

求助,如何查找细菌的全基因组序列,第1张

可以在NCBI,genome数据库。

从genome数据库里找的话就比较麻烦,想用RACE,3'末端需要添加像真核物polyA尾巴,且要克隆全基序列,要做5'RACE.

RACE技术比较适合真核物.

要克隆基保守,genbank查找些与菌亲缘关系比较近菌种,看基已经提交,全基组更,通设计同源引物,便基克隆.原核物基含内含,所基组扩增,原核物mRNA稳定.

7氨基酸序列用NCBI比找同源序列比较困难.缩范围做比,比Burkholderia基或蛋白做比(参数选择Choose Search SetOrganism限定物种).另外,用blastp找同源序列,妨用tblastnBurkholderia基组或者所细菌核酸序列比看看

.NCBI种Burkholderiagenome序列.外,关于Burkholderia脂肪酶基序列,设定关键词查,蛋白序列都载做序列比较,至少同源性,及氨基酸序列跟同源性定启示.

如果是基因组信息的话,选择框里先选择:Nucleotide

然后,输入序列号或者输入你要找的基因的名称

找到以后,点击FASTA,可以下载,也可以直接复制。

一般都是存TXT格式,这样用软件分析才能载入


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原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/10095092.html

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