数据集能挑选一部分生信吗

数据集能挑选一部分生信吗,第1张

是的,数据集可以挑选一部分生信数据进行分析。在生物信息学中,数据集通常包括大量的生物学数据,如基因组序列、转录组数据、蛋白质组数据等。这些数据集可能包含大量的冗余信息,或者可能与我们的研究问题无关。因此,为了更好地分析生信数据,需要对数据集进行筛选和挑选。

一种常见的数据挑选方法是基于实验设计或研究问题的需求,选择与问题相关的数据进行分析。例如,在研究某种疾病的基因表达调控机制时,可以选择与该疾病相关的转录组数据进行分析,而过滤掉与该疾病无关的数据。此外,还可以使用统计学方法,如主成分分析、聚类分析等方法,对数据集进行筛选和挑选,以提取最具代表性的数据集。

总之,数据集可以根据研究问题的需求进行筛选和挑选,以提高生信数据的分析效率和精度。

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国家卫健委:美国杜撰阴谋论背离科学,伤害了中方研究者

中国青年网

2021-07-22 15:29中国青年网官方帐号

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中国青年报客户端北京7月22日电(中青报·中青网记者 张曼玉)近期,有报道称中方研究者在去年删除了已经上传至美国NCBI数据库的新冠肺炎疫情早期部分病例基因序列,推测中方对溯源有所隐瞒。7月22日上午,在国务院新闻办公室举行的新闻发布会上,国家卫生健康委副主任曾益新表示,美国研究人员在没有得到中国学者的确认,完全不了解事情来龙去脉的背景下,就杜撰了所谓的阴谋论,在国际舆论界造成了很不好影响,对中方研究者进行了诬蔑、造成了伤害。这种做法是背离科学的,也违反了科学伦理。

曾益新介绍了事件的过程:报道里提到的序列删除的问题,起源于武汉大学研究人员发表的一篇论文,在国际刊物《SMALL》上,论文题目是《纳米孔靶向测序用于准确和全面检测SARS-CoV-2和其他呼吸道病毒》。去年3月,他们投稿的时候需要测序结果,所以研究者将结果上传到美国NCBI数据库。去年6月9日,杂志向研究者发送拟出版的样稿。研究者发现,文章中原有的描述病例样本病毒测序数据上传地址的内容在审稿过程中被删除了。所以研究者认为,没有必要再把数据存放在NCBI数据库中,研究者于去年6月16日给NIH发邮件要求撤回数据。NIH按照工作流程自行删除。

“从这个过程中看出,研究者完全没有隐瞒、掩盖的必要性,没有这个主观意图。近期,研究者已将所有61个新冠肺炎样本的244条测序相关数据上传到中国国家生物信息中心建设的GSA数据库,这个数据库是公开的,全球研究人员都可以看到,都可以查询。”

曾益新表示,在新冠肺炎疫情流行期间,民众对于专业人员特别是科学家高度关注,每一名专家学者都应该明白所肩负的社会责任,要尽自己的努力为全社会的疫情防控做出贡献。同时也要正确地引导舆情,不要随心所欲地猜测,造成不好的影响。

(来源:中国青年报客户端)

在生物医学信息学领域,数据库和服务的定义与计算机领域有很大的不同,如果要问NCBI过去,现在或将来会有多少数据库,恐怕连NCBI自己都说不清楚。要是一个一个数据库讲下来,9999个字肯定不够用。这里有一个列表供您参考>

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