如何查看geo数据库上既有表达谱数据又有mirna

请问将二代测序得到的序列比对到miRBase鉴定已知miRNA时，应选择miRBase中的mature序列还是hairpin序列啊？

看到miRBase中同时有hairpinfa和maturefa两个数据文件，迷惑了

ArcGIS是围绕着Geodatabase数据库构建的，它使用对象关系型数据库来存储空间数据。Geodatabase是一个存储数据集的容器，同时将空间数据和属性绑定起来。拓扑数据也能够存储在Geodatabase中并对特性进行建模，比如说在表示道路交叉时可以对道路之间的相关性进行设定。在使用Geodatabase时，很重要的一点就是要理解要素类（Feature Classes）就是就是一系列要素，它以点、线或多边形的形式呈现。在使用Shapefile格式时每个文件只能存储一类要素然而Geodatabase却能够在一个文件中存储多个要素或者是多种类型的要素。

在ArcGIS中Geodatabase可以以三种不同方式存储包括FGDB（File Geodatabase）、PGDB（Personal Geodatabase），和ArcSDE Geodatabase。FGDB在92版时被引进，它把信息储存在一个扩展名为gdb的文件夹中，文件夹内部的文件和Coverage差不多但不一样。和PGDB类似，FGDB也支持单一用户，但与PGDB不同的是，FGDB没有数据量大小的限制。默认情况下单一表的大小不能超过1TB，但这实际是可以被改变的。PGDB用Microsoft Access文件存储数据，将几何数据存储在二进制大对象字段中，OGR库能够处理这种文件类型并将它转换其它文件格式。一些需要数据库管理员完成的工作诸如管理用户及备份等可以通过ArcCatalog完成。基于Microsoft Access的PGDB仅能在Windows *** 作系统下运行而其有2GB数据量上线的限制。企业级的Geodatabase可以通过ArcSDE *** 作，它拥有可连接高端数据库管理系统（DBMS）的接口像是Oracle、Microsoft SQL Server、DB2和Infomix等。这些DBMS能够多方面的管理数据库，同时ArcGIS就用来进行空间数据的管理。企业级的Geodatabase还支持数据库复制、版本控制及事务管理等高级功能，更支持跨平台兼容，即可同时在Linux、Windows和Solaris等不同的 *** 作系统下使用。

现在form中方一个datagridview控件，然后连接好数据库，写上相应的数据库代码，你要先说你的数据库表中有什么列值，才好给你说具体的代码，因为我现在正在做类似的，而且运行成功了

如果是要初步的筛选，最好用至少3个数据库进行预测，然后取共有的target gene进行下一步的验证，常用的数据库有targetscan，RNA22，mirbase，PITA，microcosom等等

详细的解释一下：

1、SDE安装成功后在SQL Server中便会有相关的二维表，但是还不能通过Arc Catalog或者代码连接，必须要进行POST，成功后方能使用。

2、POST时最后一步便会叫你填写SDEserver（服务器名，默认为你计算机名）、service（其实代码中的实例instance就填这个名字，默认为esri_sde）、database（数据库名，默认为sde）、uername（默认为sa）、password（自行设置）。

3、如果POST成功，可以通过打开Catalog的Add Spatial Database Connections，填写上述信息后测试连接是否可用，如果可用，那么你就可以在上述的代码运行d出的窗口中输入相关信息了。

4、说明一下，ArcSDE虽然是架构在SQL Server之上，但是查看或编辑创建的数据集或者要素类这些是在Catalog里，SDE、Catalog、SQL Server、Visual Studio之间的关系是：SDE是桥梁，SQL Server是桥的一头，负责处理连接的请求，空间数据由SDE转换成二维表，SQL Server进行最底层的二维表管理，Catalog是桥的另一头，负责空间数据的可视化查看。Visual Studio是汽车，可以随时从SDE桥梁上经过访问或者编辑SQL Server那一头的数据库。

5、最后回答您的问题：虽然问的比较乱，还是简单回答一下，（1）你用这段代码建立的是与SDE数据库的连接，如果还需要实现你标题的内容（Geodatabase数据库连接与矢量数据集创建及导入的代码）还要别的代码，

（2）建立的数据库是在Catalog中查看，SQL Server肯定也对SDE这个数据库进行了更改，（但是这是SDE和SQL Server负责，具体的更改估计你也找不着）

（3）要填的信息在以上我说的第二点。

AUTHOR：余顺太

DATE：2021年10月1日

注：Filezilla软件的设置一定要根据下图重新设置，不然可能会一直中断

具体数据传输方法如下图所示：

FileZilla软件，将左侧相对应信息填入到FileZilla中，然后将需要上传的文件直接拉入到红星号的文件夹中。

全部传输结束之后对比文件大小，提交

等待邮件通知是否上传成功。

免费且只要是目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。

GEO数据库是一个储存芯片、二代测序以及其他高通量测序数据的一个数据库。利用这个数据库，我们可以检索到其他一些人上传的一些实验测序数据。

不涉及任何检测原理的角度来说的话，所谓的高通量检测，其实就是一次性检测很多指标变化的技术。例如我们说的表达谱数据，就是来检测基因表达水平。比如我们要对一个人来进行高通量检测的话，就能知道这个人上万个基因的表达水平了。

由于GEO数据库和我们之前介绍的gene数据库 [数据库推荐]gene:基因相关信息查询 以及我们常用来搜索文献的pubmed都是一个机构的。使用这个数据库，我们需要做的就是就是就是提供检索式。检索式可以是简单的几个关键词，也可以是制定特殊的检索式。

用ArcCatalog的工具创建。1显示excel与xy数据：

打开arcmap软件，选择并打开gisdata文件下的oregon文件夹，选择oregongdatamdb打开，选择gtoposhd栅格并打开，打开orstationsxls，进一步查看字段和属性2设置坐标系统：在ArcMap中右键点击表名，选择Display

XY Data(显示XY数据)，设置坐标字段。(X Field 为LON， Y Field 为LAT)，单击Edit

按钮，设置坐标系统，选择坐标系统。(GCS采用NAD

1983)：3点图层与降水数值表关联：添加ORprecipnormalsxls表以实现与orstation表关联，右击orstations表名，选择joins

and relates下的join,选择station name

作为图层关联的基础，关联的表选择orprecipnormals，两表共同的属性选择station

name，点击OK。4临时点图层导出为Geodatabase数据：右击ORstations￥Events图层，选择Data|Export

Data(导出数据)，单击Browse按钮，将Save as type更改为File and Personal Geodatabase feature

classes

，定位到mgisdata\Oregon文件夹，命名输出要素类为Precip。5创建地理数据库：启动ArcCatalog，添加gisdata文件夹，右击文件夹，选择New|Personal

Geodatabase，输入rcdata作为地理数据库的名称。6创建要素数据集：右击rcdata地理数据库，选择New,选择Feature

Dataset，命名为Admin创建要素数据集，预定义坐标系统选择UTM Zone

13N，采用相同的方法创建Environmental，Transportation和Watersystem要素集，从Admin中导入坐标系统7添加Coverage到要素数据集：右击Admin要素数据集，选择Import，选择Feature

Class(single)(单一要素类)，将LandUSE(Coverage)POLY导入Admin要素数据集中，命名为LandUSE ，其中的Field

Map中多余的字段如area，Perimeter，Landuse#字段可以删除。8添加shapefile(裁切)到要素数据集：右击Transportation数据集，选择Import|Feature

Class(single)(单一要素类)，从archive文件夹中，导入shape文件rc_roads,命名输出要素为roads，打开ArcToolbox|Analysis

Tools|Extract|Clip;以shape文件sategeol作为Clip Features，输出schools，将其放入Admin数据集中。地理国情监测云平台有相关arcgis 方面的解决方法。以上就是如何利用ArcGIS软件创建地理数据库的答案，希望你能看懂哦。

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