ncbi怎么用

ncbi使用教程

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2016-11-04 19054人看过

NCBI (National Center for Biotechnology Information）是指美国国立生物技术信息中心。理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。通过只有四个字母来代表DNA化学亚基的字母表，出现了生命过程的语法，其最复杂形式就是人类。阐明和使用这些字母来组成新的“单词和短语”是分子生物学领域的中心焦点。数目巨大的分子数据和这些数据的隐秘而精细的模式使得计算机化的数据库和分析方法成为绝对的必须。挑战在于发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的理解。在生物学研究中，NCBI提供了大量的生物信息分析工具以及文献。所以学号检索方法是进入新生物学领域的必备技能。Blast工具、PubMed文献数据库等。

工具/原料

浏览器 NCBI网址

方法/步骤

1/9 分步阅读

首先进入NCBI主页。

Map view演示，主要是找到相关基因在染色体上的位置，以人类IL-6基因为例。

点击Map View

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选择物种，点击Go；

设置filter，过滤信息；

点击Genes seq查询序列

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最后进入序列下载页面，可以直接下载。可以选择多种格式，一般选择fasta。

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通过clone查询相关基因的cDNA序列

选择clone数据库，search基因描述。

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对基因的蛋白质序列和mRNA查询。

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也可对序列进行查询。基因组展示。

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也可以查询序列信息。

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查询已知引物，通过probe数据库搜索。

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同源性比对blast。有多种比对方式。DNA,RNA,Protein等比对模式，排列越高表示同源性越强。也可以进行引物比对。

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注意事项

简单演示仍需深入了解

21世纪是生物科学的世纪

软件 NCBI

编辑于2016-11-04，内容仅供参考并受版权保护

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步骤：

打开电脑上的浏览器，然后再浏览器地址界面里输入百度主页的地址（当然，如果大家能够将Pubmed数据库的网址默写出来也可以直接将地址输入到浏览器地址框里），因为这里不允许贴地址，所以就不放地址出来，大家按照后面流程获取。

在百度搜索框里输入Pubmed关键词，然后点击搜索按钮进行搜索，这里就可以看见搜索结果的前几个网站就是Pubmed网站的地址。

选择一个网站进入，然后进入到Pubmed网站主页，点击搜索框下面的Advance按钮进入到高级搜索界面。

进入高级搜索界面之后，点击搜索界面的All filed选择搜索范围，可以选择各种各样的范围进行搜索。

小编这里选择title和Date两个范围进行搜索，在title后面的输入框里输入想要搜索的文献的关键词，第二行选择文献发表的时间，这里如果需要更多的范围限制的话，可以点击第二行后面的+号按钮添加搜索范围限制。

在搜索框里填写关键词的同时，上面的搜索框里会将整个搜索表达式展示出来，我这里显示的是：(IT[Title]) AND ("2014"[Date - Publication] : "3000"[Date - Publication])

完成上述步骤之后，然后点击下面的Search按钮展示出搜索结果。

跳转到搜索结果界面，在搜索框里展示了刚刚出现的检索表达式，下面就是搜索出来的文献。

PubMed 是一个免费的搜寻引擎，提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学，但亦包括其他与医学相关的领域，像是护理学或者其他健康学科。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的资源，像是生化学与细胞生物学。该搜寻引擎是由美国国立医学图书馆提供，作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文，但可能提供指向全文提供者（付费或免费）的链接。

PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据，3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。

因为PubMed是由美国国立生物技术信息中心-National center for biotechnology information(NCBI)推出的数据库，所以在PubMed页面左上角有NCBI字样。My NCBI 相当于你自己在PubMed中个人注册的个人账户界面，需要注册或者登陆。在“My NCBI”中，可以对检索主题的保存情况进行设置；给检索式命名并定期将最新的信息发送到邮箱中等，这样可以对PubMed重的相关信息进行跟踪，当再次进行同样地检索 *** 作时，就不需要逐个输入检索词，而仅仅运行保存的检索策略就可以了。

你到Pubmed，输入关键词 rice salt tolerance

可以搜到耐盐的文献

>

打开Pubmed后，在最顶上的下拉框中选中nucleotide, 然后输入基因的名称，这样查出来的一般是mRNA序列

如果在下拉框中选Gene，则查出来的一般是该基因的其他信息。

注意，结果一般会有好多，选中你要的种属。

以上就是关于ncbi怎么用全部的内容，包括:ncbi怎么用、pubmed数据库中高级检索的步骤及方法各是什么、简答：PubMed中的My NCBI 包括什么内容等相关内容解答，如果想了解更多相关内容，可以关注我们，你们的支持是我们更新的动力！