在ncbi上我搜到了一个蛋白~我如何知道这个蛋白有没有3d结构？

所有的蛋白都有3D结构。如果想看的话可以在ncbi该蛋白的基因页面里找到UniProtKB的链接，再从UniProt里的Cross-references找到3D structure databases。

不放心的话，可以在string啦，或者其他的数据库中找相关的链接，看看有没有PDB的相关标号，就是4位由数字和字母混合成的晶体结构标号。

几方面一综合，就知道有没有了。不过如果不是关键蛋白质的话不要抱太大的希望，结晶难度很大，所以存在的晶体结构不是很多的，没有晶体结构的3D结构都是预测或者推测的，不作数。

NCBI上对于这些同源蛋白的名字已经有了明确的规定了，可以去NCBI上搜索这些蛋白，结果里会包含这些蛋白的详细信息，包括碱基序列，氨基酸序列等。

PDB文件可以由各种3D结构显示软件打开，比如pymol，Swiss-PDB viewer，VMD等。PDB文件里面的信息是有严格的格式的。各行数据,如标识,原子名,原子序号,残基名称,残基序号等,不仅要按照严格的顺序书写,而且各项所占的空符串长度,及其所处的各行的位置都是严格规定。