参考的教程:
Submitting high-throughput sequence data to GEO
How to upload files to GEO
以及我师兄给我写的教程
大致的流程从网站上截取下来的
准备的数据有三个
There are three required components for the spreadsheet-based submission method:
数据准备完之后就是需要上传这些数据到GEO ftp 上,这个过程比较麻烦,GEO 的服务器真的是不太好用,速度很慢。
有几个方案可以选择:
这个方法缺点在于文件会中断,你每次中断之后需要续传真的很麻烦,而且有时候会出现
读取目录失败 连接被服务器关闭等问题 第一次登陆时也出现这个问题真的是百度了很久没有解决 后来到官网一看 原来人家早已经想到这个问题了真的是血的教训要好好看官网教程
但是后来还是会时常连接中断 感觉是geo ftp 不太稳定
大致是会出现这个问题 之后按他们说的方法就可以解决问题了
我用FileZilla传完数据,但是不知道是不是因为续传的原因只有一个数据是完整的 其他数据geo 工作者说是corrupted 然后我看了geo 服务器上的数据和本地服务器上的数据是一样的 并不知道为什么他们说不一样 难过
1.Using 'lftp'
2.Using 'sftp' (expect slower transfer speeds since this method encrypts on-the-fly)
3.Using 'ncftpput' (transfers from the command-line without entering an interactive shell)
这个方法是可以挂在后台跑的就是挂在自己服务器上跑 让它自己慢慢传就是速度真的很慢啊 最后一个还是比较方便一点
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