GEO数据库全称GENE EXPRESSION
OMNIBUS,是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据,也就是说只要是目前已经发表的论文,论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。
2、那GEO数据库有哪些检索入口呢?
最常用的有两种方式,如果你知道GSE编号可以通过网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo直接进入,具体编号介绍文件下载方法见:https://www.omicsclass.com/article/1100
另外一种就是通过NCBI主页的入口基因搜索下载。通常是不知道GEO编号,通过样品类型,实验处理,平台信息等搜索筛选想要的GEO数据:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/,进入NCBI主页,搜索数据选择GEO DataSets,如果搜索某个基因表达量可选择GEO Profiles。
要在GEO数据库中找到对应文章,可以使用GEO数据库的搜索功能。您可以按照关键字、主题或作者等信息进行搜索,以便找到您所需的文章。您也可以使用GEO数据库的筛选功能,根据文章的发表日期、出版社、语言等信息进行筛选,以便更加准确地找到您所需的文章。此外,您还可以使用GEO数据库的高级搜索功能,根据文章的标题、关键词、摘要等信息进行搜索,以便更加精准地找到您所需的文章。欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出
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