可使用的方式大约有三种:
1、以的方式来存储,也就是列类型为二进制,存储的是化学分子式的图
2、以HTML代码方式来存储,使用Varchar或Nvarchar类型,存储的是化学分子式的HTML表达方式
3、使用复杂的关系表,来表示每个化学元素与其电子量,也就是说,例如:C₂就需要有两列来存储,一列存储的是C,另外一列存储的是2
以上方法,个人推荐2。仅供参考
根据需要从一级数据库中搜集对象的相关数据集合而成的就是二级数据库。
像genebank,EMBL这种都是不加选择的一级数据库,只要是实验获得的,不管什么东西的序列,哪怕是不完整的序列都能上传,而且它们的数据也有可能有重复。如果有某个人专门研究细菌的鉴定,需要用到正式被认可的16srDNA序列,为了研究方便,把这些一级数据库的各个种类细菌的公认标准16srDNA序列的数据进行整理,重新构建了一个数据库,这就是所谓的二级数据库。如果不构建,直接用一级数据库做blast,就会得出很多未被承认甚至不完整的序列,还要人工一个个看过去,找出公认的标准序列,这样就很麻烦。我举得例子在现实中就是韩国的EzTaxon。
NCBI上可以查分子量,还有其它的方也可以查。我推荐几个吧:
Genecards: :>
NCBI无法查询蛋白质等电点,可以到swissprot查询。
这个NCBI没有相关的功能,这个是以核苷酸序列为主。因为等电点特性是蛋白质水平的分子特性,可以到swissprot进行查询,查询蛋白质等电点需要到专业的平台进行查询。
另外NCBI开发有Genbank等公共数据库,提供Pubmed、BLAST、Entrez、OMIM、Taxonomy等工具,可对国际分子数据库和生物医学文献进行检索和分析。
扩展资料:
NCBI开发用于分析基因组数据和传播生物医学信息的软件工具。NCBI支持与推广多种医学及科技方面的数据库,如:三维蛋白质结构的分子模型数据库(MMDB)、孟德尔人类遗传(OMIM)等。
另外使用CD-Search工具来可以鉴定蛋白质或者核酸序列内的保守结构域或功能单位。该工具位于NCBI中。可以进入NCBI后选择ConservedDomain中的Search。
除此之外这个网站Search的**部分其中CD-search只能提交单条序列,BatchCD-Search可以上传多条序列,里面收录的数据范围是比较广的,可以利用NCBI进行检索。
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