国家基因组科学数据中心怎么用

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国家基因组科学数据中心（NGDC）---组学原始数据如何上传GSA 原创

2022-04-25 14:44:31

sisichen �

码龄4年

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文章目录

前言

一、什么是NGDC？

二、NGDC的发展历程

三、什么是GSA？

四、为什么选择上传数据到GSA？

五、如何上传测序原始数据至GSA？（重点！！附详细步骤！！）

1 准备要上传的数据

2 计算MD5码

3进入NGDC主页，登入账户

4 填写数据信息

第一步：建立Bioproject。

第二步：建立BioSample。

第三步：创建GSA。

进入GSA数据库

新建GSA

填写信息

下载表格文件

5 数据上传：

(1) 通过FTP软件 上传（上传需要流量！！如果小数据可以用）

(2) 通过服务器上传（推荐！！）:如果实验室有服务器的话，推荐服务器上传，步骤如下：（服务器上要先安装ftp ）

（3）邮寄硬盘

6等待审核

总结

前言

在发表文章之前我们需要将测序的原始数据上传到一个公共库，并在文中提供accession number，实现数据的公开共享，这是国际惯例。以前我们上传数据时只能上传到美国国立生物技术信息中心（NCBI）、欧洲生物信息学研究所（EBI）、日本核酸数据库(DDBJ)，现在中国科学院北京基因组研究所（国家生物信息中心）国家基因组科学数据中心 (CNCB-NGDC)—中国的 “NCBI” 已经建立并日渐完善。组学原始数据归档库（GSA）是组学原始数据汇交、存储、管理与共享系统，是国内首个被国际期刊认可的组学数据发布平台。GSA已获得多个国际期刊认可，并已被国际著名出版商Elsevier收录为指定的基因数据归档库，其权威性得到国内外100余家学术杂志的认可。GSA已通过FAIRsharing认证，获得Wiley出版集团认可，因此我们不用担心上传数据到GSA不被期刊认可，也不用再舍近求远上传数据到NCBI，作为中国人，我们一定要支持我们NGDC中的数据库。本文介绍了如何上传测序原始数据到GSA，附详细 *** 作步骤。

一、什么是NGDC？

国家基因组科学数据中心（>

以上就是关于国家基因组科学数据中心怎么用全部的内容，包括:国家基因组科学数据中心怎么用、开网页是显示：无法打开登录所请求的数据库 "GTDB"。请问是什么原因呢、等相关内容解答，如果想了解更多相关内容，可以关注我们，你们的支持是我们更新的动力！