国家水稻数据库里面基因结构怎么看

可以选择红色方框里的数据库，主要用前面两个：genomic sequence 和 CDS sequence。

1、分别是基因组序列和CDS（mRNA）序列。这里选择基因组序列数据库

2、在红色方框里粘贴FASTA格式的序列

3、点击“submit”提交

4、点击blast result 中的 accession下的 LOC号，即红色方框的内

5、在以下页面中，即可下载序列（分别有CDS序列和genomic序列），还可以在 genome browser中查看该基因在基因组中染色体的位置等信息，还有基因结构的信息。该图中浅色部分是UTR，深色部分是CDS

6、用genome browser中查看该基因信息，点选track下的general中的DNA/GC content ，--->update image ，再放大图像即可看到以下结果。

IARS2-003指isoleucyl-tRNA synthetase 2基因003转录本。

ENST00000490891是IARS2-003的transcript ID，OTTHUMT00000090763是另一个数据库对同一转录本的编号（Havana transcript）。

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