转录组数据分析时为什么要将nr数据库比对到unigene

转录组数据分析时为什么要将nr数据库比对到unigene,第1张

简单地说, 高通量测序时,在芯片上的每个反应,会读出一条序列,是比较短的,叫read,它们是原始数据; 有很多reads通过片段重叠,能够组装成一个更大的片段,称为contig; 多个contigs通过片段重叠,组成一个更长的scaffold; 一个contig被组

在GeneBank 中查找基因序列只要输入accession号就可以了 ,下面网址就是一个基因的全部序列信息的例子,>

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在取type字段内容时,把nr的内容也取出来,把nr内容先隐藏,在点击type内容的时候用js显示nr内容就行了,示例如下,假设rtype和rnr是从数据库取出的内容

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