如何在geo数据库中找到对应文章

要在GEO数据库中找到对应文章，可以使用GEO数据库的搜索功能。您可以按照关键字、主题或作者等信息进行搜索，以便找到您所需的文章。您也可以使用GEO数据库的筛选功能，根据文章的发表日期、出版社、语言等信息进行筛选，以便更加准确地找到您所需的文章。此外，您还可以使用GEO数据库的高级搜索功能，根据文章的标题、关键词、摘要等信息进行搜索，以便更加精准地找到您所需的文章。

先注册NCBI账号，在： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

然后注册GEO账号，在： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/submitter/

GEO可上传的数据类型种类主要集中在芯片和高通量数据，比如芯片数据的四大主流：Affymetrix、Agilent、Nimblegen、Illumina，高通量的RNA-Seq、ChIP-Seq、ATAC-Seq等。另外还有RT-PCR、SAGE数据可以上传

重点需要提交三部分：

基因表达、基因调控、表观以及其他功能基因组学研究，例如

与文章相关的内容

与样本信息相关的内容

样本的实验 *** 作以及建库流程，简单描述即可

数据处理描述，比如基因组版本是什么、怎么比对、怎么过滤、怎么找peaks、怎么定量

数据处理后的文件名称

如果使用了双端测序数据，需要列出各自的名称

首先会看到自己的上传目录，一会将用到

然后设置FileZilla：

此时会发生报错，忽略它

修改Remote site，然后回车连接：

最后就可以将本地数据上传到GEO指定位置了

Tips：为了避免FileZilla上传过程出现中断，可以 设置断点续传

并且会提示再核实一遍信息，没有问题的话5个工作日内就会进行审核

免费且只要是目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。

GEO数据库是一个储存芯片、二代测序以及其他高通量测序数据的一个数据库。利用这个数据库，我们可以检索到其他一些人上传的一些实验测序数据。

不涉及任何检测原理的角度来说的话，所谓的高通量检测，其实就是一次性检测很多指标变化的技术。例如我们说的表达谱数据，就是来检测基因表达水平。比如我们要对一个人来进行高通量检测的话，就能知道这个人上万个基因的表达水平了。

由于GEO数据库和我们之前介绍的gene数据库 [数据库推荐]gene:基因相关信息查询 以及我们常用来搜索文献的pubmed都是一个机构的。使用这个数据库，我们需要做的就是就是就是提供检索式。检索式可以是简单的几个关键词，也可以是制定特殊的检索式。

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