ncbi geo数据库怎么使用

ncbigeo数据库怎么使用CDS(CodingSequence)特征域被认为是DNA生成蛋白质的翻译指令,利用CDS特征域构建外显子-内含子数据库(Exon-IntronDatabase,EID)是研究内含子起源、进化和功能的重要手段

在NCBI的GEO数据库中，系列（series）中matrix目录下的GSExxx_series_matrixtxtgz文件，其中的数据是什么含义。是不是别人已经标准化好的数据（而且是log2处理过的），我可以用来直接求倍数然后看表达差异

GSExxx_series_matrixtxtgz数据格式和楼主的数据截图类似，差别在于列标题，楼主的列标题是GSMxxxxxxCEL,而从GEO下载的GSExxx_series_matrixtxtgz的数据，列标题是GSMxxxxxx，无“CEL”。

ID_REF GSM413894 GSM413895 GSM413896 GSM413897 GSM413898 GSM413899 GSM413900 GSM413901

AFFX-BioB-3_at 8472861 758379 7726437 7808923 8604332 860782 8343771 8628157

AFFX-BioB-5_at 865537 7696443 7996466 7719412 8770542 8652599 8404749 8911979

AFFX-BioB-M_at 8813823 7890245 8127718 8306655 9011187 891993 8566244 906862

AFFX-BioC-3_at 9633732 9024885 9136383 9120244 102995 1015661 1000954 1025113

AFFX-BioC-5_at 9756588 9118516 9137075 9544678 9945514 9793713 9544567 9861975

AFFX-BioDn-3_at 120726 1167344 1162215 119874 1216764 1197144 1181811 120963

geo数据库显示连接被服务器关闭解决办法：

1、点击电脑左下角菜单图标。

2、打开菜单找到右侧的控制面板并点击。

3、在控制面板界面中，点击管理工具，打开后点击服务。

4、右键点击WindowsFirewall，停止。

GEO筛选差异，KOBAS注释分析。

GEO数据库来筛选差异表达基因，KOBAS进行KEGG注释分析

利用基因在不同物种之间的保守性，任何基因组的数据都可以映射到这些数据库中去。

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