生物催化和生物降解的数据库及网址有哪些

一般来说所用的分析工具有在线跟下载的下面简要列举一些常用在线软件的使用1、使用VecScreen工具，分析下列未知序列，输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。一、步骤：

打开google首页，搜索VecScreen，进入VecScreen首页，复制序列，运行，Viewreport。

二、结果：

输出序列长度918bp，载体序列的区域456bp——854bp

克隆载体：M13mp18phage，pGEM-13Zf()，pBR322，pRKW2。

2、使用相应工具，分析下列未知序列的重复序列情况，输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及MaskedSequence。

一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的。

进入google首页，搜索，进入主页，进入，复制序列，DNAsource选择human，运行！点击超链接，在结果中选择

AnnotationFile：_1287631711outhtml

3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具，分析下列未知序列，输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占的百分比及Obs/Exp值。一、步骤：

进入google首页，搜索CpGPlot，进入CpGPlot主页，program中选择cpgreport复制序列，运行！

二、结果：

CpG岛的长度：385bp

区域：48——432；

GC数量：SumCG=297，百分数=7714

Obs/Exp：101、4、预测下面序列的启动子，输出可能的启动子序列及相应的位置。一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的

进入google首页，搜索NeuralNetworkPromoterPrediction，进入主页，复制序列，选择eukaryote，运行！

二、结果：

位置：711—761，1388—1438，1755—1805；

5、运用SpliceSitePrediction工具分析下面序列，分别输出内含子－外显子剪接位点给体和受体的区域及剪接处位置的碱基。一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是human的

进入google首页，搜索SpliceSitePrediction，进入主页，复制序列。Organism选择Humanorother。其他默认，运行！

二、结果：

供体：

受体：

6、对下面序列进行六框翻译，利用GENESCAN综合分析(首先确定给定序列的物种来源)哪个ORF是正确的，输出六框翻译（抓图）和GENESCAN结果(包括predictedgenes/exons和predictedpeptidesequence(s)两个部分)。一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST。得出序列是Zea的

进入google首页；搜索NCBI，进入主页，选择allresources（A~Z），选择O，选择ORFfinder。复制序列，默认，运行！

二、结果：ORF图

三、步骤：进入google首页，搜索GENESCAN，进入主页，Organism:Maize，，其他默认，运行！

四、结果：

G7、进入REBASE限制性内切酶数据库，输出AluI、MboI、EcoI三种内酶的RecognitionSequence和Type。

一、步骤：进入google首页，googleinEnglish，搜索REBASE，进入主页，分别输入AluI、MboI、EcoI，运行！

在MboI中选择第一个，EcoI选择第二个。

二、结果：

ENSCAN图

8、使用引物设计工具，针对下列未知序列设计一对引物，要求引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃。请写出选择的一对引物（ForwardPrimerandReversePrimer）、及相应的GC含量、引物的位点、Tm值和产物长度。一、步骤：进入google首页，搜索genefisher，进入主页，复制fasta格式，chechkinput，sunmit，；；设置一下引物长度为20-25bp，扩增产物长度300-500bp，退火温度为50-60℃；。

二、结果：

GC含量：

引物的位点：

Tm值：

产物长度：。

9、将下面的序列用NEBcutter20工具分析，用产生平末端及有四个酶切位点的酶进行酶切，并用抓图提交胶图（viewgel），要求14%agarose和Marker为100bpDNALadder。

一、步骤：

进入google首页，进入ICBI主页，对序列进行BLAST，得知是linear。

进入google首页，搜索NEBcutter20，进入主页，选择linear，运行！选择customdigest，，把“1”改为“4”，选择平末端，后digest。Viewgel。选择14%agarose和Marker为100bp。

二、结果：

然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot适用于检索的computepi/mw求理论分子量分子量protparam物理化学性质protscale亲水性疏水性peptidemass分析蛋白酶和化学试剂处理后的内切产物

NCBI(>

数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较（BLASTN）

蛋白质序列与数据库中蛋白质序列比较（BLASTP）

两序列比对（Aligntwosequences）

DNA序列分析——ORFFinder(>

分析实验序列外显子部分——GENSCAN（genesmite/GENSCANhtml）

分析实验序列的可能酶切位点——NEBcutter20(toolsneb/NEBcutter2/indexphp)

注：Customdigest--viewgel

限制性内切酶数据库——REBASE(rebaseneb/rebase/rebasehtml)

设计引物扩增实验序列——Genefisher

Primer3

蛋白质序列分析及结构预测：

1预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy（ComputepI/Mw）

2分析蛋白质的基本物理化学性质：ExPASy（ProtParam）

3分析蛋白质的亲水性和疏水性：ExPASy（ProtScale）

4分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物：ExPASy（PeptideMass）[：kinaseK]

5分析蛋白质的信号肽：ExPASy（SignalP）

6预测蛋白质的二级结构：ExPASy（Jpred3）

多物种分子系统发育分析：EMBL（>

人脂联素蛋白质序列：NP_004788

人类胰岛素生长因子IB前体：P05019

SQL Server 2008(sql2008)安装图解教程

SQL Server 2008(sql2008)

注：安装SQL Server 2008之前，必须预先安装NET Framework 35

1、在Windows7 *** 作系统系，启动Microsoft SQL2008安装程序后，系统兼容性助手将提示软件存在兼容性问题，这里选择“运行程序”开始SQL Server 2008的安装。

2、进入SQL Server安装中心后跳过“计划”内容，直接选择界面左侧列表中的“安装”，进入安装列表选择。右侧的列表显示了不同的安装选项。本文以全新安装为例说明整个安装过程，因此这里选择第一个安装选项“全新SQL Server独立安装或现有安装添加功能”。

4、选择全新安装之后，系统程序兼容助手再次提示兼容性问题，选择“运行程序”继续安装。

5、进入“安装程序支持规则”安装界面，安装程序将自动检测安装环境基本支持情况，需要保证通过所有条件后才能进行下面的安装，当完成所有检测后，点击“确定”进行下面的安装。

注意：如果此处重启计算机项失败，请按以下提示

a、重启机器，再进行安装，如果发现还有该错误，请按下面步骤

b、在开始->运行中输入regedit

c、到HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager 位置

d、在右边窗口右击PendingFileRenameOperations，选择删除，重新扫描

6、接下来是SQL Server2008版本选择和密钥填写，点击下一步，本文以“Enterprise Evaluation”为例介绍安装过程。

SQL Server 2008 序列号：

Enterprise: JD8Y6-HQG69-P9H84-XDTPG-34MBB

Developer:　PTTFM-X467G-P7RH2-3Q6CG-4DMYB

7、在许可条款界面中，需要接受Microsoft软件许可条款才能安装SQL Server2008，点击下一步

9、进入“功能选择”界面，这里选择需要安装的SQL Server功能，以及安装路径，点击下一步

建议：由于数据和 *** 作日志文件可能会特别庞大，请谨慎选择安装路径，或在建立数据库时选择专有的保存路径。

如果更改目录报错，那么请按以下步骤

a、在开始->运行中输入regedit输入“regedit”，运行注册表编辑器

b、找到hkey_local_machine\software\microsoft\windows\currentversion

c、在窗口的右侧找到programfilesdir键和CommonFilesDir键，更改其键值为你希所望的默认安装路径，确认

10、接下来是“实例配置”，这里选择默认的ID和路径。

10、确认安装目录

11、在服务器配置中，需要为各种服务指定合法的账户。注意：这里需要根据用户实际需求做出调整，本文没有深入研究用户设置的影响，统一使用一个默认用户。

12、接下来是数据库登录时的身份验证，这里需要为SQL Server指定一位管理员，本文以系统管理员作为示例，建议：在服务器上安装SQL Server时，安全起见为此建立独立的用户进行管理。

13、为“Analysis Services配置”指定管理员，本文以系统管理员作为示例。建议：在服务器上安装SQL Server时，安全起见为此建立独立的用户进行管理。

14、在报表服务配置中选择默认模式，用户可根据需求选择。

15、“错误和使用情况报告”界面中可选择是否将错误报告发送给微软。

16、最后根据功能配置选择再次进行环境检察

17、当通过检察之后，软件将会列出所有的配置信息，最后一次确认安装，点击“安装”开始SQL Server安装。

18、根据硬件环境的差异，安装过程可能持续10-30分钟。

19、当安装完成之后，SQL Server将列出各功能安装状态。

20、此时SQL Server 2008完成了安装，并将安装日志保存在了指定的路径下。

Oracle 没有像SQL Server里的master db那样的系统数据库。这两个数据库的结构是不相同的。在SQL Server里，在一个“INSTANCE”下，可以存在多个数据库。所以，除了master，msdb，model，tempdb这些系统数据库外，用户还可以创建一个或者多个用户数据库。可是，在Oracle里，在一个“INSTANCE”下，只能存在一个数据库。那些数据库系统信息，是储存在“SYSTEM”表空间里的，并且由系统用户“SYS”所拥有。

安装Oracle时默认的数据库，实际上是一个范例数据库 (sample database)。你对它干什么都行，增删表格或者删除整个数据库。事实上，范例数据库通常是给人们学习用的。正规的大型数据库从来不用安装时默认的范例数据库。DBA必须根据实际要求，创建一个新的数据库。

在stdafxh中添加如下语句

//导入msado15dll动态库

#import "C:\\Program Files\\Common Files\\System\\ado\\msado15dll" rename_namespace("ADODB") \rename("EOF","ADOEof") 

using namespace ADODB ;       //应用命名空间

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