如何用gi编号在NCBI中查找序列

如何用gi编号在NCBI中查找序列,第1张

GI编号是NCBI网站的所有序列相关数据库的流水编号,其最有用的特征就是唯一性。对于每一条递交给NCBI的序列,都会付给一个编号,而且这个编号对应的序列不可更改。这个编号对应这个唯一的一条序列,类似与我们用的身份z号。因此,利用GI在NCBI中查询时,你只要把数据库(蛋白质/核苷酸)选对,只要输入这个号码就可以把相应的序列调出来。

值得一提的是登录号(Accession Number)。每一个递交的序列,除了获得一个GI号,还会被赋予一个登录号。递交序列的作者利用登录号对序列进行修改和完善。每一次修改的序列会获得一个新的GI号,登录号不变,但会追加一个流水的版本号。

因此,GI号和带版本号的登录号都唯一定位到唯一条序列。

和生物有关的话,GI的全称应该是gene identification的意思。

随着人类基因组计划的进行以及结束,为了使基因组数据达到共享的目的,生物学家在网上开发了很多基因组数据库,其中NCBI数据库就是其中之一。在NCBI数据库中,基因都会有自己特定的GI号,类似于身份z,根据基因对应的GI编号可以在数据库中找到相应基因的注释,CDS,基因组定位等许多相关的内容。

差不多就是这样了。

直接在NCBI首页选Protein搜索你的GI号码,得到唯一一个符合的蛋白进去找NM_开头的一个号码,这个是NCBI所有数据库通用的。比方说果蝇的actin gi号码是 GI:442615249,搜索得到NM_001014725的accession号码,直接有对应基因号码和序列


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原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/9502726.html

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