gcbi数据库可以查找生物类的基因信息吗

gcbi数据库可以查找生物类的基因信息

序列比对的基本问题是比较两个或两个以上符号序列的相似性或不相似性从生物学的初衷来看,这一问题包含了以下几个意义:从相互重叠的序列片断中重构DNA的完整序列在各种试验条件下从探测数据(probe data)中决定物理和基因图存贮,遍历和比较数据库中的DNA序列比较两个或多个序列的相似性在数据库中搜索相关序列和子序列寻找核苷酸(nucleotides)的连续产生模式找出蛋白质和DNA序列中的信息成分序列比对考虑了DNA序列的生物学特性,如序列局部发生的插入,删除(前两种简称为indel)和替代,序列的目标函数获得序列之间突变集最小距离加权和或最大相似性和,对齐的方法包括全局对齐,局部对齐,代沟惩罚等两个序列比对常采用动态规划算法,这种算法在序列长度较小时适用,然而对于海量基因序列(如人的DNA序列高达109bp),这一方法就不太适用,甚至采用算法复杂性为线性的也难以奏效因此,启发式方法的引入势在必然,著名的BALST和FASTA算法及相应的改进方法均是从此前提出发的

问题不是很明确，是想进行序列比对与结构比对吗？序列比对用ncbi网站中的blast就可以分别进行核酸与蛋白的比对，蛋白结构比对，如果没有晶体结构，就需要先同源建模，再进行结构拟合就可以了！希望能帮到你，有问题欢迎追问！

蛋白水平

单基因分析singlegeneanalysis

检索框输入目的基因→GOPIA→单基因分析模块

总览（general）

提供基因基本信息以及其他门户、人体组织表达分布；泛癌差异表达散点图、柱状图；基因的不同转录本和相似基因表（与XX基因共表达相关性最高的基因）。

差异表达基因分析（DifferentialGenes）

点击左侧导航栏DifferentialGenes→选择瘤种、差异表达基因界值、最小单位、表达上调还是下调、list还是plot。

核酸序列数据库（genbank）和基因组数据库（ensemble）的区别：

1、GenBank

是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区（CDS）特征的注释，还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织，包括EMBL和DDBJ。

2、Ensemble数据库可为药物研发提供超过167,000种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来，便于查询。Ensemble可从药品专利开始，再通过其临床前和临床研究资料，直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。数据库每月更新一次，每年增加约10,000

种新化合物。

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