arrayexpress生存信息在哪里

ArrayExpress是高通量功能基因组数据的一个公共数据库。ArrayExpress由两部分组成 ——ArrayExpress Repository，它是一个MIAME（Minimum Information About a Microarray Experiment）支持的微阵列数据的公共档案库，及ArrayExpress Data Warehouse，它是选自档案库的基因表达谱及一致性重注释的数据库。归档的实验能够通过实验属性，例如关键词，物种，阵列平台，作者，期刊或访问号进行查询。基因表达谱能够通过基因名字和属性，例如基因本体论术语进行查询，并且基因表达谱能够被可视化。ArrayExpress是一个快速增长的数据库，目前它包含的数据来自超过5万次的杂交和超过1500000次的独特表达谱。

ArrayExpress与Geo数据库类似，里面都存储了大量的芯片表达数据，对于数据库挖掘的学员们来说，ArrayExpress是一个不可或缺的数据库。比如如果你在在GEO数据库中搜索不到想要的结果时，可以在ArrayExpress数据库中搜索，它与GEO数据库互补，帮助大家完成数据的搜索和下载，方便后续的分析。

欧洲生物信息研究所简称：EMBL-EBI。

欧洲生物信息研究所（EMBL-EBI）全称EMBL - European Bioinformatics Institute，是一个非盈利性的学术机构，致力于以信息学手段解答生命科学问题。

该所建立于1994年，位于英国剑桥南部的维康信托基因园，是欧洲分子生物学实验室（EMBL，全称EuropeanMolecular Biology Laboratory）的一部分。

欧洲生物信息研究所为科学界提供免费生物信息资源、促进基础研究、提供培训和传播行业尖端技术。

欧洲生物信息研究所管理和维护着多个大型生物信息公共数据库， 跨基因组学，蛋白质组学，化学信息学，转录组学，系统生物学等，同时创建了多种工具供让研究人员分析和分享信息。

欧洲生物信息研究所提供最优质的研究环境、无数跨学科的合作机会以及遍及世界各地的培训课程。欧洲生物信息研究所拥有超过20年生物信息学研究和服务经验，是全球收集和传播生物数据、提供免费生物信息服务的欧洲节点。

该所管理维护着世界最全面的分子生物数据库，其中很多是生物学家熟悉的数据库，例如ENA（核酸序列数据库），Ensembl（基 因组），ArrayExpress（基因表达数据），UniProtKB蛋白质序列。

ENA由原EMBL-Bank核酸序列数据库基础上发展起来，是欧洲最重要的核酸序列资源，与美国NCBI的GenBank和日本的DDBJ组成国际核酸序列数据库合作联盟（INSDC）。

这三大数据库各自收录了世界上所报道的所有序列数据的一部分，并且每天实时更新交换各自的序列信息。

癌细胞全部转录本的数据库有很多，如TCGA (The Cancer Genome Atlas)、CCLE (Cancer Cell Line Encyclopedia)、HGMD (Human Gene Mutation Database) 等。这些数据库都整合了大量的癌症组织和细胞系的转录组测序数据，提供了基因表达水平、突变情况、染色体重排、分子亚型等信息，可以为癌症研究和治疗提供参考。

至于TERRA转录本是否能被查询到，则取决于所使用的数据库。

举例来说，TCGA数据库中包含了 TERRA 转录本的表达信息，可以通过 TCGA 数据门户网站进行检索与下载。而其它一些数据库可能没有包含 TERRA 的信息，需要具体查询。

要寻找已发表文章的转录组，首先需要明确所需研究的基因或生物系统。接着就可以通过在线数据库查找，如GEO、ArrayExpress、SRA等，这些数据库中存储了大量公开发表的原始转录组数据。在这些数据库中，可以使用关键字搜索、分类浏览等多种方式找到与自己研究相关的数据。一旦找到了目标数据，就可以下载并进行数据处理、分析，以获取自己需要的转录组信息。同时，可以通过PubMed等文献检索工具，查找关于该基因或生物系统的相关发表论文，以更深入地了解转录组数据的意义和应用可能。

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