tcga clinical数据怎么整合

tcga工作组发的文章。The Cancer Genome Atlas （TCGA， 数据库。TCGA数据源大部分都是公开的。目前来能够从TCGA数据库中提取数据的处理工具有cBioPortal ），ICGC（ 和GenePattern（

tcga工作组发的文章。

The Cancer Genome Atlas （TCGA， 数据库。TCGA数据源大部分都是公开的。

目前来能够从TCGA数据库中提取数据的处理工具有cBioPortal ），ICGC（ 和GenePattern（

一个良好的开端就是分析感兴趣基因的突变和其它异常，ICGC数据门户提供了几条研究路线。输入一个基因名称，NCBI登录号，或者Ensembl基因ID，点击基因报告（Gene Report），就能在突变摘要（Mutation Summary）中找到已发现的突变和拷贝数变化，以及迄今为止，这些突变在肿瘤中出现的频率。COSMICsection就在体细胞突变列表下方，包括了点突变，少量缺失，以及插入突变等方面的数据。

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