分子生物学中 Xq12.113表示什么意思,染色体的什么部位

分子生物学中 Xq12.113表示什么意思,染色体的什么部位,第1张

目前全世界约有400余名第三代“试管婴儿”出生,其标志是植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis, PGD)技术的应用。植入前遗传学诊断是指通过体外受精获得的胚胎在送入母体宫腔前取一个或几个胚胎细胞进行遗传学分析。据估计,人群中约有1/4到1/5的人患某种遗传病,平均每人携带5~6个致病基因。这将对未来的人类造成巨大的遗传负荷(genetic load),因此PGD的产生与完善使得“试管婴儿”技术不再局限于不孕症的治疗,它在阻断遗传病传播、降低人类遗传负荷上都具有重要意义。 #Sg /

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在进行PGD时,遗传物质发生变化的方式不同,因此采用的分子生物学方法也不同。大体可将此技术归为四类:染色体分析、DNA分析、RNA分析和蛋白质分析。 tx3p, X

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染色体分析 2j>C4Ck

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人类23对染色体,任何染色体数目或结构发生变化,均将导致某种综合征。由于促排卵药物的应用以及体外环境中诸多因素的影响,使得体外受精获得的胚胎染色体异常率高达30%左右,一些胚胎发育阻滞也与染色体异常有关。因此在植入前对染色体进行分析是十分必要的。 CS"k0V44}

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染色体分析普遍采用荧光原位杂交(FISH)。其原理是:将DNA探针用不同颜色荧光染料标记,可与固定在玻片上的卵裂球细胞不同染色体杂交后,在荧光显微镜下呈现不同颜色的荧光。通过这种方法可以在5~6小时内分析5条或6条以上染色体[1]。FISH流程中最费时间的步骤是杂交。根据使用的探针不同需要30分钟至过夜。Liu等在检测X和Y染色体时采用微波处理使变性、杂交时间缩短至1分钟,全过程只需40分钟就可完成[2]。 7BA9zs392

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FISH简要 *** 作流程为:第一步,将卵裂球细胞固定在玻片上。第二步,漂洗玻片破胞。第三步,脱水。第四步,荧光标记探针,并使之与卵裂球染色体杂交。第五步,漂洗除去背景染料。第六步,加入DAPI负染,并在荧光显微镜下观察。 +w3k_^X9c

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由于FISH耗时少,不存在细胞丢失造成的误诊,因此成为常规筛查手段。通过FISH可以筛查多倍体、单倍体、单体、三体、多X、多Y以及染色体平衡易位等[3]。国外主张对35岁以上以及三次IVF失败的患者在植入前行FISH。 uUpOa+t

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DNA分析 Zf`dd T

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迄今已有1 000多种遗传性疾病的基因被定位,随着人类基因组计划(HGP)工作的进展,人类所携带的10万对基因密码将全部揭示,为PGD提供直接可靠的依据。在PGD中,可提供的细胞极少, PCR成为样品预处理的基本方法。 h@ BA<'S

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本课题受黑龙江省95攻关课题资助 7[ra#>e8'

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作者单位:150086 哈尔滨医科大学附属二院妇产科 jlZW!$ Iq

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PCR已成功地用于进行性肌营养不良(DMD)、X-脆性染色体、新生儿溶血、a -地中海贫血、囊性纤维病(cystic fibrosis)等遗传性疾病的PGD。另外,其它疾病如:黑朦白痴(Tay-Sachs)、进行性锥肌萎缩(Werding Hoffman disease)等疾病也可用分子生物学的方法进行检测。多种改进PCR被用于PGD。 AcYL3

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1 引物延伸预扩增(primer extension preamplification,PEP) U:`g12

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对植入前胚胎的单个细胞的单拷贝基因进行 *** 作,其难度是可想而知的。如果将这个单细胞的整个基因组全部扩增,使目的基因成为多拷贝,再针对该目的基因进行二次扩增,那么其技术难点不攻而破。首先采用多个随机引物扩增染色体任意片段,再用目的基因的引物扩增目的基因,其可靠性和灵敏度都有所提高。PEP主要用于单基因遗传病的诊断。Veyer等采用PEP法对RH新生儿溶血病RH(D)基因进行研究,并应用于PGD,预防新生儿溶血病的发生。 qE[Y0Cd

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2 巢式PCR T%xB|^lf

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采用两个反应系统、两套引物,可以提高PCR产物特异性,许多遗传性疾病已采用巢式PCR进行检测,如囊性纤维病、黑朦白痴[4]、新生儿溶血[5]、Marfan综合征[6]等。 j%KLp4J/e

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3 原位PCR %97IXrE

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原位PCR是PCR扩增技术与原位杂交技术的完美结合。其原理是先将卵裂球细胞固定在玻片上,在原位上对目的基因进行PCR扩增,然后通过原位杂交法对目的基因进行检测。其基本过程为:第一步,将卵裂球细胞用福尔马林、多聚甲醛或酒精溶液固定在玻片。第二步,采用蛋白酶、胰酶等消化细胞膜。第三步,在玻片上进行PCR,盖上盖片封口后,置专门的玻片式PCR仪上进行扩增。一般采用热启动PCR开始首次循环。第四步,原位杂交检测,可以在扩增后与标记探针杂交检测,也可在PCR反应过程中掺入地高辛、生物素或荧光素标记的dUTP,直接检测PCR产物。 Kl$!_$

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原位PCR技术使原位杂交技术的灵敏度大大提高,可用于测定低单拷贝的DNA序列,并进行定性、定量、定位分析。它具有快速、灵敏、准确等优点,被认为是FISH的潜行替代者。 Y2w 9]:J

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4.免疫PCR pWB)N7x&

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免疫PCR是PCR法与ELISA法的融合技术,它利用了PCR的大量扩增能力和抗原抗体反应的特异性。其原理是将目的基因的PCR扩增产物用生物素标记,检测突变的特异性探针用地高辛标记,二者经变性退火处理后加到含抗生物素的酶标板内,通过显色来鉴定突变是否存在。根据显色深浅绘制曲线,做定量分析。该法已用于囊性纤维病CFTR等基因突变的检测。 hg11xa

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5 荧光标记定量PCR(TaqMan PCR) ~y^#;

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TaqMan PCR的特色之处是除常规引物外,还使用两端标记了荧光素的DNA探针(TaqMan探针),该探针可与目的基因内部的一段序列互补杂交,当新链合成到TaqMan探针杂交处时,Taq酶可将其切除而继续延伸反应,只有完全互补杂交的DNA链才能被Taq酶分解,因此通过该法可鉴定出两个基因间数个碱基的差异。另外,通过测定荧光可随时对产物进行定量分析。 U\ yP:yy

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6 等位基因特异性扩增(allele-specific amplification , ASA) o 1#XM/Z

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ASA主要用于点突变导致的遗传病的检测。其原理是:在设计引物时,根据已知突变位点的特征,在引物3’端或中间设计一错配碱基,使之仅能与突变型或野生型基因互补,而只扩增相对应的突变型或野生型基因。其优点是只需一步PCR,而无需电泳技术和标记技术,摆脱了分子生物学中电泳瓶颈现象。在此基础上发展起来的ASA法的颜色互补分析(color complementation assay)是在相互竞争的突变型和野生型引物中,分别采用不同荧光染料标记扩增的DNA,直接对扩增产物进行判读。另外采用内嵌引物也可提高产物特异性和产量,采用具有特定酶切位点的内嵌式引物,DNA扩增后用酶切割,根据酶切产物便可明确是否有基因突变,该法已应用于单个精子的DNA分析。 P~i^V;g

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7.微卫星DNA的PCR(SRS-PCR) <2ffcBv

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多基因遗传病主要为一些常见病(如精神分裂症、哮喘、原发性高血压、糖尿病、冠心病、风湿性关节炎等)和先天畸形(如唇裂、脊柱裂、无脑儿、先天性心脏病等),目前其易感基因研究常用的遗传标记是微卫星标记。微卫星DNA(microsatellite DNA)又称简单重复序列(SRS),能参与遗传物质的结构改变、基因调控,是基因重组和基因变异之源。SRS重复序列拷贝数可以发生突变,表现为动态突变。X-脆性综合征、强直性肌营养不良、Kennedy’s综合征,脊髓小脑共剂失调I等遗传性疾病都与之有关。SRS-PCR已用于X-脆性染色体的PGD。将X-脆性等位基因归为正常、前突变型和完全突变型三种。这段重复序列在正常个体中存在多态性,从6个到50个重复不等。完全突变型CGG重复数超过200个病伴有甲基化,表现为智力低下。具50~200个重复并无甲基化为前突变型,其智力低下可能性很小[7]。 djPr 4Nog

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8 甲基化特异PCR(M-PCR) %g0"Kj5

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某些遗传疾病与DNA甲基化有关,如Prader-Willi综合征(PNS)和Angelman综合征(AS)患者CpG岛发生差异甲基化而使基因失活。M-PCR原理是设计CpG岛的甲基化和非甲基化的特异引物各一对,进行特异性扩增来鉴定基因组印迹现象。 \"_;rJ{!aE

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DNA分析往往以已知基因序列为前提,因此,需要了解基因突变数据,人类基因突变数据库(HGMD)为基因分析提供了便利条件。HGMD包括已发表的碱基替换、缺失、复制、插入及重排等突变,可在世界广域网上共享,通过上网便可查询遗传病基因突变的数据信息。 wv ,F>5P

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RNA分析 {;Mcor3

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在进行PGD时卵裂球细胞只能取1-2个,滋养外胚层细胞也只能取5-10个细胞,DNA 的含量很低,如果已知某种与遗传病有关的基因在体外培养期间确实已开始表达,那么测定mRNA则是遗传病诊断的另一途径,其优点是底物拷贝数相对较多。 [_L:,]g8

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RT-PCR法 0D|^S<z6

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RT-PCR法进行遗传分析的原理是将遗传病基因所表达的mRNA反转录成cDNA,再对cDNA进行扩增,来检测目的基因。目前已将RT-PCR法应用于Marfan综合征患者的PGD[8]。 ~e~4S~{

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基因表达的微点阵分析 lYFmF}k

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卵裂球细胞遗传物质的任何改变都将导致基因表达的变化,卵裂球细胞是否正常发育,是否有细胞凋亡迹象,将体现在RNA表达中。Brown小组正在研制一种新的基因表达分析系统—微点阵分析(microarray assay),他们将人类已知基因的cDNA用荧光标记与滴加待测样品的点阵玻片杂交,通过扫描器测定荧光光谱,经计算机软件处理可以定量监测某一基因的表达。该方法非常快速,一天内可检测几千个基因的活性。那么如果设计一个完善的符合体外培养细胞的cDNA文库的点阵玻片,那么PGD 迄不成了一个自动化测定的过程。此项工作还未应用于PGD,是一项前景可观、有待开发的领域。 8{5c6G

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蛋白质分析 f gIHha

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蛋白质与生物特性直接相关,对蛋白质分析是PGD的另一个方向。被称为“临床分子扫描器”的质谱仪可用于细胞抽提物中蛋白质2D凝胶斑点鉴定。其原理是细胞内蛋白质在电泳过程中,根据所带电荷和分子大小被分离开呈现由1000-3000个斑点组成的特征图谱,其中每个斑点代表一个蛋白,蛋白斑点图谱不仅可以显示蛋白质含量,而且还能够显示它是否进行了翻译后修饰。图谱的变化往往反应出某种疾病,尤其是蛋白质翻译后修饰发生变化被认为是导致疾病的征兆[10]。关于植入前胚胎细胞蛋白组的研究目前尚无报导。 "sUL"i

dER$SM

五、其它技术 9y>dDNM\<

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男性不育患者通过IVF或ICSI技术可以获得后代,但子代仍面临不育可能。 ['tGc{4

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因为5%-20%的无精和寡精是由基因缺陷造成的,包括Y染色体上的单拷贝基因DAZ(Deleted in Azoospermia)和多拷贝基因RBM(RNA recognition motif)家族片段缺失[11]。对于此类患者主张植入女性胚胎,另外对于Y-连锁性疾病,亦要求植入女性胚胎。因此,需要在受精前筛选出X精子。采用FISH或PCR法检测精子,具有破坏性,不能再用于受精。利用一种无毒性且在胞内只暂短停留的荧光染料加染精子,根据两种精子核质量不同,经流式细胞仪分离出X和Y精子,其受精率仍可达65%以上。受精前精子遗传学诊断有利于提高胚胎质量,增加可利用胚胎数,减少卵子的浪费。 \WQ\q \

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DNA芯片技术是近年来发展起来的新技术,利用它可以在基因组水平上进行基因表达、基因突变和多态性分析以及遗传制图和序列测定,现已应用于人类疾病的诊断。它具有快速、准确、低耗的特点。一次可对上千种基因进行分析,其精细度可达单个细胞单拷贝。不久,在芯片上对某一患者的全部基因组的遗传分析将成为常规。 2h IM!wQ

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人类基因组计划带来的基因组革命与PGD 结合必将使人类在认识自己、防治疾病、自主生命上有一大的飞跃,必将由此而引发人类第三次技术革命。 I ^TabL

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摘 要 4`I2tr

-Ds}kdxw

目的:鉴定并评估能用于人胚胎植入前遗传学诊断的分子生物学方法。 cV\(Z6u

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资料来源:来源于我们的一部分工作并检索了中国杂志以及美国 妇产科杂志、美国生殖与避孕杂志等。 JF!JY( U,

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研究选择:能用于1个细胞中低拷贝DNA或单拷贝DNA检测的分子生物学方法。 v8VwCe`f

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结果:我们将植入前遗传学诊断技术归为四类:染色体分析、DNA 分析、RNA 分析以及蛋白质分析。该技术已成功地用于10多种遗传性疾病的植入前诊断,世界上已有约400名行植入前遗传学诊断的试管婴儿诞生。采用单精子注射法可以使无精或寡精患者有孩子,但其后代仍面临不孕可能,因此建议将X、Y 精子分离后采用女性胚胎植入。 ;R|i@[(J

)e(Rf!P{

结论:根据遗传物质改变的情况不同,用于植入前遗传学诊断所采用的方法也不同,随着人类基因组计划的进展和分子生物学的发展,对人类全部基因组的遗传分析将成为常规。 s6bILz-u

DDxbIkt

+;^Ux W

语法:

--insert into TO_DB_NAME[对应数据库的用户名称dbo-<登录名sa>]TO_TABLE_NAME(COLUME1,COLUME2) select (COLUME1,COLUME2) from FROM_DB_NAME[[对应数据库的用户名称dbo-<登录名sa>]]FROM_TABLE_NAME;

insert into master[dbo]a_Table1(id) select sm_id from hgmd_in_msg[dbo]T_SendMsg

本人在MS 2000中实验成功

目的数据库master

目的表 a_Table1

目的列 id

来源数据库hgmd_in_msg

来源表 T_SendMsg

来源列 sm_id

查询分析器执行结果:

(所影响的行数为 8 行)

除了文献以外,也可以考虑OMIM数据库>

癌细胞全部转录本的数据库有很多,如TCGA (The Cancer Genome Atlas)、CCLE (Cancer Cell Line Encyclopedia)、HGMD (Human Gene Mutation Database) 等。这些数据库都整合了大量的癌症组织和细胞系的转录组测序数据,提供了基因表达水平、突变情况、染色体重排、分子亚型等信息,可以为癌症研究和治疗提供参考。

至于TERRA转录本是否能被查询到,则取决于所使用的数据库。

举例来说,TCGA数据库中包含了 TERRA 转录本的表达信息,可以通过 TCGA 数据门户网站进行检索与下载。而其它一些数据库可能没有包含 TERRA 的信息,需要具体查询。

根据《国家医疗保障局办公室关于贯彻执行15项医疗保障信息业务编码标准的通知》,为加快形成全国统一的医疗保障信息业务编码标准,现就做好国家医保编码的对码贯标工作紧急通知如下:

一、贯标产品

所有在省医药采购服务平台挂网采购的药品医用耗材(不含检测试剂),都需要开展对码贯标工作。

二、工作内容

对比国家医疗保障局编制的药品医用耗材信息表,查找与挂网药品、医用耗材相同的产品信息,选填对应的国家医保编码。

三、 *** 作方法

(一)药品贯标

1已挂网药品的贯标。药品生产企业登录“药品议价采购系统”,进入“基础数据库管理”-“产品信息维护”,勾选挂网药品后,点击“编辑医保代码”按钮,选择对应的药品关联医保药品代码,如未查询到相同的药品,勾选“暂未取得国家医保编码”,点击确定。

2申请挂网的新上市药品的贯标。药品生产企业登录“药品议价采购系统”,在“基础数据库管理”-“产品信息注册”,点击“新增”按钮,在“医保药品代码”中选择对应医保代码。

(二)医用耗材贯标

1已挂网医用耗材的贯标。耗材生产企业登录“医用耗材挂网交易系统”,进入“基础管理”-“国家医保代码贯标”菜单,选择单件进行关联或通过Excel导入方式进行关联。如未取得国家医保编码的,勾选“暂未取得国家医保编码” ,点击确定。

2申请挂网的新上市医用耗材的贯标。耗材生产企业登录“医用耗材挂网交易系统”,进入“基础管理”-“企业耗材信息上报”菜单,点击“新建”按钮,在“医保耗材分类代码”中选择对应医保代码。

(三)注意事项

如未查找到本企业挂网产品的医保编码,请登录国家医疗保障局官网,进入“医保业务编码标准动态维护”栏目进行维护,待取得医保编码后,后期再进入省医药采购服务平台进行贯标。

待双击运行数据库备份的文件

XXXCMD

内容:

isql

-U

用户名

-P

密码

-S

数据库IP

-i

待执行备份的SQL文件

举例:

//hgmd_incmd

isql

-U

sa

-P

sa

-S

127001

-i

hgmd_insql

待执行备份的SQL文件

XXXSQL

内容:

use

待备份数据库名

go

backup

database

数据库名

to

disk='磁盘路径'

with

init

go

//hgmd_insql

--

数据库:hgmd_in

use

hgmd_in

go

--先备份数据库

backup

database

hgmd_in

to

disk='d:\hgmd_in_0301abak'

with

init

go

1中国知网

中国知网

2中国生物医学文献服务系统(可以查到大部分sci,并且免费下载PDF版本)

>

以上就是关于分子生物学中 Xq12.1/13表示什么意思,染色体的什么部位全部的内容,包括:分子生物学中 Xq12.1/13表示什么意思,染色体的什么部位、把一个数据库表中的一个字段的数据全部导入到另一个库的表中的一个字段。。。求SQL语句、如何在网上查找一个疾病的所有相关基因等相关内容解答,如果想了解更多相关内容,可以关注我们,你们的支持是我们更新的动力!

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