postgresql数据库怎么查询所有的序列名

postgresql数据库怎么查询所有的序列名,第1张

postgresql中一个序列对象通常用于为行或者表生成唯一的标识符。

查看序列:

psql 的 \d 命令输出一个数据库对象,包括 Sequence,表,视图和索引。你还可以使用 \ds 命令只查看当前数据库的所有序列。例如:

pigdb-# \ds

List of relations

Schema | Name | Type | Owner

--------+-----------------------+----------+--------

public | author_ids| sequence | ichexw

public | shipments_ship_id_seq | sequence | ichexw

(2 rows)

在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下点击进入序...

首先到JGI主页,选择一个物种,然后用Key

Words

search,或者Blast,找到目的序列。点这个目的序列。会出现一排目录,一个基因,一般是About

this

gene,

Sequences,peptide

Homologs,

Gene

Ancestry,

Get

Data,点Sequences就可以得到DNA,cDNA等。如果你想得到两端更长序列,还可以在Show

flanking

sequence调

upstream和downstream,然后点Update

sequence


欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出

原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/9602270.html

(0)
打赏 微信扫一扫 微信扫一扫 支付宝扫一扫 支付宝扫一扫
上一篇 2023-04-30
下一篇 2023-04-30

发表评论

登录后才能评论

评论列表(0条)

保存