查看序列:
psql 的 \d 命令输出一个数据库对象,包括 Sequence,表,视图和索引。你还可以使用 \ds 命令只查看当前数据库的所有序列。例如:
pigdb-# \ds
List of relations
Schema | Name | Type | Owner
--------+-----------------------+----------+--------
public | author_ids| sequence | ichexw
public | shipments_ship_id_seq | sequence | ichexw
(2 rows)
在NCBI主页上方search栏左边有一个database选择框,点击下拉三角形选择nucleotide(如图红框)在search栏输入基因名搜索即可.以人的orc1基因为例,在搜索结果中选择mRNA和complete cds序列的结果都可以,如下点击进入序...首先到JGI主页,选择一个物种,然后用KeyWords
search,或者Blast,找到目的序列。点这个目的序列。会出现一排目录,一个基因,一般是About
this
gene,
Sequences,peptide
Homologs,
Gene
Ancestry,
Get
Data,点Sequences就可以得到DNA,cDNA等。如果你想得到两端更长序列,还可以在Show
flanking
sequence调
upstream和downstream,然后点Update
sequence
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