随着对circRNA研究的越来越多,已知的circRNA数据信息在快速增长,在这里我们肽度时界(timedoo)整理了当前circRNA相关的数据库列表,希望能帮到您:
1circBase[1],是一个通过收集和整合已经发布的circRNA数据构建的数据库。目前该数据库收集包括以下6个物种的circRNA信息:人 (hg19)、小鼠(mm9) 、秀丽线虫(ce6)、黑腹果蝇 (dm3)、矛尾鱼 (latCha1)、腔棘鱼 (latCha1)。该数据库最新版本发布时间为2014年1月。网址:>
一个从ChIP-Seq数据中解码长链非编码RNA和microRNA基因转录调控的数据库
长链非编码RNAs(lncRNAs)和microRNAs(miRNAs)代表了真核生物中两类重要的非编码RNAs。尽管这些非编码RNAs涉及到生物体发育和各种人类疾病,但是令人惊讶的是有关它们的转录调控知之甚少。染色体免疫沉淀和下一代DNA测序(ChIP-Seq)的最新进展已经以空前的敏感性提供了检测转录因子结合位点(transcription factor binding sites,TFBSs)的方法。本研究中,我们描述了ChIPBase(>
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