NCBI上查找该基因的序列哪位了解啊能介绍一下生物论坛吗

知道了基因名(即Symbol)，怎样在NCBI上查找该基因的序列。Symbol是基因的名称，在文献是可以经常看到的，经常会提到某个基因的基因名。我们就可以用Symbol在NCBI的Gene数据库搜索。 但有一点需注意，Symbol是经常会改变的，就是说随着序列的升级，对该基因的研究更加深入，Symbol会改变。但这个基本上不会影响使用，因为NCBI仍然会保留旧的基因名。用旧的Symbol在Gene数据库搜索同样有效。 可以到生物帮那里看下，那里提供最新、领先、精准、全面的生物产品和技术信息。 please click to connect 主页：>

男，32岁，右上臂刀割伤16小时。查体：T365℃,P80次/分钟，R18次/分钟,BP120/80mmHg,神志清楚，双肺呼吸音，未闻及干湿性啰音，心律齐，腹软，无压痛，右上臂外侧纵行伤口长约4cm，边缘尚整齐，清创后，伤口不缝合，此时伤口内应放置的引流物是（请求答案和解释）

A硅胶管

B生理盐水纱条

C烟卷纱条

D乳胶片

E乳胶管

你好！登录PUBMED官网，然后点击genomeic这个选项，输入关键词进行查询就好。如果你的英语不够好，可以借助工具书或者有道词典来进行翻译。当然，你也可以直接询问你的师姐师兄或者导师。

它会询问你在什么时间将序列公布：

1：

1，提醒你的两个问题。

NCBI的GenBank提供了两个投递方式，要注意NCBI发给你的电子邮件许多期刊在文章发表之前需要在文章中有序列的登录号, PC和UNIX不同版本。

另外、本地投递文件生成程序——Sequin

另外，上面所述一般适用于研究单个或多个功能基因的情况、 STS和GSS序列分别有专门的投递途径，序列可以被读者索取，并且要求你在文章发表时，这通常是出错的地方（seqin）

2、在你投递序列到发表文章之间。如果大规模的测序如EST、在线投递－BankIt。目前NCBI seqin有MAC。

2，特点是比较方便、对你所投序列所属物种分类（拉丁名）要有所了解。其输出文件需要你通过电子邮件发给NCBI。

具体细节你可以浏览参考资料所指连接

Spinger错数据库,再推荐几:

1 NCBI(美立物技术信息) 数据库

查阅内容丰富,仅查阅文献,检索蛋白质,基序列,些已完测序物全基组序列等比Ecoli等

2 ISIKnowledge

专业英文文献检索系统

3 美化

我物,呵呵,些都精华,与享,主要要看所单位没些数据库访问权

建议多看看书

别人的只能参考，没有意义

知道了名字，在搜索框里输入后可以看到相应的搜索结果，然后点击进去，有个“MIM”（在线孟德尔遗传）就可以看到它的功能。

ORF是开放阅读框，指的是mRNA上编码氨基酸的那段序列，从AUG开始，直到终止子，但是不包括终止子。ORF的数据在进入NCBI主页的右下侧一个叫ORFfinder的超链接里，点击进去后输入相应序列的mRNA序列，然后再点击ORF find就可以预测处它的ORF，但是往往会有很多结果，一般来说第一个结果是真实的，其余的都是假阳性的。

fasta格式指的就是一个大于号开头，后面跟上这段序列的描述，然后另起一行就是数列，给你个例子你就知道了，如下，这就是人类USF1 mRNA的fasta格式

>gi|46877100|ref|NM_0071223| Homo sapiens upstream transcription factor 1 (USF1), transcript variant 1, mRNA

AACATGGCCGCGGGCTGGAAGTGCGCATGAGCAGCTGTCTATGGAGATACCTAGGCCGGGAGAGGGAGAA

CACAGTTGGAGAAAATCGGCAGCTGAGACGGCCTTGGCCGGACTTAGCACTCAGGCCTGTGAATCAGGAG

ATACAAAGACCTCCAAAAAAGGACCAGTTCCTCGGATGTGCCCCCTCACAGAGAGATGAAGGGGCAGCAG

AAAACAGCTGAAACGGAAGAGGGGACAGTGCAGATTCAGGAAGGTGCAGTGGCTACTGGGGAAGACCCAA

CCAGTGTGGCTATTGCCAGCATCCAGTCAGCTGCCACCTTCCCTGACCCCAACGTCAAGTACGTCTTCCG

AACTGAGAATGGGGGCCAGGTGATGTACAGGGTGATCCAGGTGTCTGAGGGGCAGCTGGATGGCCAAACT

GAGGGAACTGGCGCCATCAGTGGCTACCCTGCCACTCAATCCATGACCCAGGCGGTGATCCAGGGTGCTT

TCACCAGTGATGATGCAGTTGACACGGAGGGGACAGCTGCTGAGACGCACTATACTTACTTCCCCAGCAC

GGCAGTGGGAGATGGGGCAGGGGGTACCACATCGGGGAGTACAGCTGCTGTTGTTACTACCCAGGGCTCA

GAGGCACTGCTGGGGCAGGCGACCCCTCCTGGCACTGGTCAATTCTTTGTGATGATGTCACCACAAGAAG

TACTGCAGGGAGGAAGCCAGCGCTCAATTGCCCCTAGGACTCACCCTTATTCCCCGAAGTCAGAAGCTCC

CCGGACGACTCGGGATGAGAAACGCAGGGCTCAGCATAATGAAGTGGAGCGTCGCCGCCGAGACAAGATC

AACAACTGGATCGTGCAGCTCTCCAAGATAATCCCAGACTGCTCTATGGAGAGCACCAAGTCTGGCCAGA

GTAAAGGTGGGATTCTATCCAAAGCTTGTGATTATATCCAGGAGCTTCGGCAGAGTAACCACCGCTTGTC

TGAAGAACTGCAGGGACTTGACCAACTGCAGCTGGACAATGACGTGCTTCGACAACAGGTGGAAGATCTT

AAAAACAAGAATCTGCTGCTTCGAGCTCAGTTGCGGCACCACGGATTAGAGGTCGTCATCAAGAATGACA

GCAACTAACTATGGGGATTCAGGGGCTTTGGGCCCAAGAACTGCAGATAGCCCAGGAGCAACAGCCTAAT

CCCGTGCCCCTTTCCTTCACTGCCCCACTTCTGGCATGGGACAGGGGGAAGTTCAGAAGGTGTGTCCTTG

AACTGAGGCCCTGTGATATGGCGGCCTGCAGTGGTGTGAAACACACAATGTGGACGTGCACTGACAGCCT

TGCCCACCCCCACCATGCAGCCCCTGGGCCCTTGTGCTCCTCTCGCACAATGCATGTGCTGTCTCCATGC

TGGATACTGGACACACTAAACTCTGGGGCTTGTCCTGTGCTTGCTTAGAGTGCCCAGCAGAGGTTTGCTG

ACAGGTGATGCTCTGGCTTGCCCCAGGACTCTGGCACTTCCATTGGTTCTTCCTTTCCCTGGAGCTGAGG

TTTAGATGTGCAACCTGTGGCTCAGGGGAGCAAGCTTACACAAGAAGTGAGGGAAGGATGTTTAGCAGTG

GCTGGTGCCCATGAAGAGGAGATTGGCCAGTGAGAAGCTGAGGCCTATGCAGACATCTCTGGAGCCAGAG

AGAACAACAGGCAGGGGCCCACTTGGGGCCTTCCCCCTTGTGGGGGTCGTTTTTTTTTTTTCTTTTCTTT

TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGATAAAATTGTTCAAAGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

AAAAAAAAAAA

这就是fasta格式，你可以以TXT的方式保存，也可以以后缀名为fasta的方式保存，然后以文本文件打开就行了，说白了就是个文本文件呵呵。一般情况下这样就可以了，但是如果用blast2go来做GO分类的话，就必须用fasta来保存，否则该软件不识别。详细的在NCBI上都有的，自己可以去看。

。

事实上，在NCBI有很多种办法可以确定某个基因的外显子或者内含子，当然还有UTR区域。今天我们来介绍NCBI的其中一个使用软件Splign来在NCBI上找到一个基因的外显子和内含子。 *** 作步骤如下：

1在Gene数据库，填入基因名HNF-4，我一般的话习惯叫Symbol，每个基因都有个Symbol，即基因名。

2我们来mouse的HNF4基因来作为今天的例子。Symbol会随着版本的升级而变化，当然，以前使用过的基因名也会保留着。而Symbol会对应一个GeneID，无论Symbol如何改变，GeneID是唯一的。这个ID是非常重要的。在这个页面，我们将看到HNF4基因的结构图，从图中给出的信息可以看出，HNF4基因有10个外显子。蓝色部分是UTR区，显示在5’端有一小段序列和3’端有一大段序列是UTR。

3在HNF-4基因的RefSeq区域，我们将可以看到这个基因的参考序列，有mRNA和基因组的。这个区域不一定每个基因都有。NM_开头的序列都是参考序列。

4接下来我们进入Splign的online界面，你可以通过mRNA和基因组的Accession或是它们Fasta格式的序列进行对比，要注意基因组的序列不要太长。推荐直接在下拉框选项里选择，一般常用的生物都在。

5结果一目了然，10个外显子，而且还显示mRNA以及对应的基因组比对的序列，并且还可以知道某个外显子在mRNA序列上的区域。就连UTR区的序列也知道了。

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