kegg是什么意思

kegg是什么意思,第1张

kegg是一个整合了基因组、化学和系统功能信息数据库。全称Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(京都基因和基因组百科全书)。

与其他数据库相比,kegg的一个显著特点就是具有强大的图形功能,它利用图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系,这样可以使研究者能够对其所要研究的代谢途径有一个直观全面的了解。

kegg是一个综合数据库,它们大致分为系统信息、基因组信息和化学信息和健康信息,进一步可细分为18个主要的数据库。可以通过不同的颜色编码来区分。

我们可以根据自己所要查询的信息,在不同子数据库里具体查询,也可以在总页面的上方输入关键字查询,输入的关键词越多,查询到的结果越快捷精确。

kegg建立了kegg直系同源系统(theKEGG Orthology (KO)system),这个系统通过把分子网络的相关信息连接到基因组中,从而发展和促进了跨物种注释流程。

结果表明,kegg被当做一个参考知识库,被广泛的用于基因组测序和其他高通量实验技术得到的大规模数据集的整合和解释中。

除了保持对基础研究的支持,随着kegg分子网络的一些小变化,kegg正在朝着更加偏向于实际应用的方向发展,这些应用主要集中在整合人类疾病、药物和其他与健康相关的物质。

GEO筛选差异,KOBAS注释分析。

GEO数据库来筛选差异表达基因,KOBAS进行KEGG注释分析

利用基因在不同物种之间的保守性,任何基因组的数据都可以映射到这些数据库中去。

可以。KEGG(Kyotoencyclopediaofgenesandgenomes,)是系统分析基因功能、基因组信息的数据库,它整合了基因组学、生物化学以及系统功能组学的信息,有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究。KEGG提供的整合代谢途径查询十分出色,包括碳水化合物、核苷酸、氨基酸等代谢及有机物的生物降解,不仅提供了所有可能的代谢途径,还对催化各步反应的酶进行了全面的注解,包含其氨基酸序列、到PDB数据库的链接等。KEGG数据库是进行生物体内代谢分析、代谢网络分析等研究的强有力工具之一。其整合了基因组、化学和系统功能信息综合性的数据库,由18个子数据库组成。


欢迎分享,转载请注明来源:内存溢出

原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/9783771.html

(0)
打赏 微信扫一扫 微信扫一扫 支付宝扫一扫 支付宝扫一扫
上一篇 2023-05-01
下一篇 2023-05-01

发表评论

登录后才能评论

评论列表(0条)

保存