怎样批量计算基因编码区长度

怎样批量计算基因编码区长度,第1张

核酸序列数据库(genbank)和基因组数据库(ensemble)的区别:

1、GenBank

是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。

2、Ensemble数据库可为药物研发提供超过167,000种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来,便于查询。Ensemble可从药品专利开始,再通过其临床前和临床研究资料,直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。数据库每月更新一次,每年增加约10,000

种新化合物。

1、安装cache之前必须先安装IIS。 //用来解析CSP

IIS在控制面板->添加或删除程序 ->添加/删除Windows组件 ->Internet信息服务(IIS)添加;

2、cache(Ensemble)安装步骤总共十二步;

3安装完成后 shutdown数据库。

4拷贝原库Cachecpf到EnsembleSys根目录下,cpf中主要配置数据库存放路径,根据事情情况可以自己修改cpf文件,或者在System management Portal->Local Databases->Home->Configuration->Local Databases->Edit;

5拷贝Cachekey到EnsembleSys\Mgr根目录下;

核酸序列数据库(genbank)和基因组数据库(ensemble)的区别:

1、GenBank 是一个有来自于70,000多种生物的核苷酸序列的数据库。每条纪录都有编码区(CDS)特征的注释,还包括氨基酸的翻译。GenBank属于一个序列数据库的国际合作组织,包括EMBL和DDBJ。

2、Ensemble数据库可为药物研发提供超过167,000种生物活性化合物包括化学结构在内的必要信息。本数据库利用用户容易掌握的界面将数据、文本和图象资料有机地结合起来,便于查询。Ensemble可从药品专利开始,再通过其临床前和临床研究资料,直至注册信息、市场概况及其他方面的相关资料来跟踪药物。数据库每月更新一次,每年增加约10,000 种新化合物。

foxpro

CDX格式的文件也称为复合索引文件和类似使用Microsoft Windows支持的数据库应用程序IDX文件。 IDX文件在另一方面称为紧凑的索引文件。在存储于文件CDX复合索引的下部区段的叶节点相关联,以在索引某些标记,一个IDX文件的索引不同。

微软开发的CDX格式和Microsoft Visual FoxPro程序,这是一个可以用来创建,打开和查看进一步修改一个CDX数据库文件的内容的应用程序。微软Windows的用户可以安装微软的Visual FoxPro软件开始创建和查看这些CDX文件的内容或将内容添加到现有的CDX数据库文件。

扩展资料

visual foxpro同VB、DELPHI一样都是程序开发工具,VFP由于自带免费的DBF格式的数据库,在国内曾经是非常流行的开发语言,现在许多单位的MIS系统都是用VFP开发的。VFP主要用在小规模企业单位的MIS系统开发,当然也有像工控软件、多媒体软件的开发中。

由于VFP不支持多线程编程,其DBF数据库在大量客户端的网络环境中对数据处理能力比较吃力,加之微软推出了SQL数据库,另有VB、VC等编程工具,所以对VFP的投入逐渐减少,目前微软已经明确表态,VFP9将是VFP最后一个版本。

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