如何查看geo数据库上既有表达谱数据又有mirna

如何查看geo数据库上既有表达谱数据又有mirna,第1张

请问将二代测序得到的序列比对到miRBase鉴定已知miRNA时,应选择miRBase中的mature序列还是hairpin序列啊?

看到miRBase中同时有hairpinfa和maturefa两个数据文件,迷惑了

ArcGIS是围绕着Geodatabase数据库构建的,它使用对象关系型数据库来存储空间数据。Geodatabase是一个存储数据集的容器,同时将空间数据和属性绑定起来。拓扑数据也能够存储在Geodatabase中并对特性进行建模,比如说在表示道路交叉时可以对道路之间的相关性进行设定。在使用Geodatabase时,很重要的一点就是要理解要素类(Feature Classes)就是就是一系列要素,它以点、线或多边形的形式呈现。在使用Shapefile格式时每个文件只能存储一类要素然而Geodatabase却能够在一个文件中存储多个要素或者是多种类型的要素。

在ArcGIS中Geodatabase可以以三种不同方式存储包括FGDB(File Geodatabase)、PGDB(Personal Geodatabase),和ArcSDE Geodatabase。FGDB在92版时被引进,它把信息储存在一个扩展名为gdb的文件夹中,文件夹内部的文件和Coverage差不多但不一样。和PGDB类似,FGDB也支持单一用户,但与PGDB不同的是,FGDB没有数据量大小的限制。默认情况下单一表的大小不能超过1TB,但这实际是可以被改变的。PGDB用Microsoft Access文件存储数据,将几何数据存储在二进制大对象字段中,OGR库能够处理这种文件类型并将它转换其它文件格式。一些需要数据库管理员完成的工作诸如管理用户及备份等可以通过ArcCatalog完成。基于Microsoft Access的PGDB仅能在Windows *** 作系统下运行而其有2GB数据量上线的限制。企业级的Geodatabase可以通过ArcSDE *** 作,它拥有可连接高端数据库管理系统(DBMS)的接口像是Oracle、Microsoft SQL Server、DB2和Infomix等。这些DBMS能够多方面的管理数据库,同时ArcGIS就用来进行空间数据的管理。企业级的Geodatabase还支持数据库复制、版本控制及事务管理等高级功能,更支持跨平台兼容,即可同时在Linux、Windows和Solaris等不同的 *** 作系统下使用。

geo数据库显示连接被服务器关闭解决办法:

1、点击电脑左下角菜单图标。

2、打开菜单找到右侧的控制面板并点击。

3、在控制面板界面中,点击管理工具,打开后点击服务。

4、右键点击WindowsFirewall,停止。

你好,是准确的。这个就涉及到GEO2R的使用目标了。GEO2R只适用于 表达谱芯片分析。但是GEO数据里面,并不止是包括表达谱芯片数据。还包括一些二代测序的数据。而二代的数据是不能这么简单的分析的,这也是为什么我们在第一次介绍GEO的时候,就说,现在常规的容易入门的数据分析类型还是 表达谱数据。

一般我们在GEO检索结果的时候,如果可以用GEO2R分析的,都会显示。

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