怎样在NCBI搜索小鼠p53基因编码区全长序列，具体点最好，英文不太好。。拜托啦

1、进入NCBI主页，在下拉框中选择GENE，然后输入p53，点击进入，出现摘要页面，选择物种Mus musculus（在右边物种栏），更新摘要页面，选择你想要的基因，点击后进入基因的报告页面，点击右侧的reference sequence，下拉找到genomic sequence 点击genbank链接，进入该基因的序列描述页面，找到CDS选项，就是这个基因的编码全长序列。

2、或者，进入NCBI主页在下拉框中选择nucleotide，输入p53，点击进入，出现摘要页面，选择物种为Mus musculus，更新摘要后选择你想要的mRNA种类，进入该mRNA的报告页面，找到CDS，得到连续的全长编码序列。

人胰岛素的一级结构序列如下;

MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKTRREAEDLQVGQVELGG

GPGAGSLQPLALEGSLQKRGIVEQCCTSICSLYQLENYCN

鼠胰岛素的一级结构序列如下;

MALWMRFLPLLALLFLWESHPTQAFVKQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPMSRREVEDPQVAQLELGG

GPGAGDLQTLALEVAQQKRGIVDQCCTSICSLYQLENYCN

比较如下;

放大以及加下划线的是人与小鼠相同的一级结构序列。不同的一级结构序列是字体比较小的那部分。

从两者的比较中，我们可以知道，人与小鼠的胰岛素一级结构序列基本相同，只有一些个别部分不同。

说明了：一级结构不同，生物学功能各异

一级结构中关键部位相同，其功能相同;关键部位改变，生物活性也改变

如何在数据库里面找到疾病相关的microrna表达情况：好像还没有这样的数据库。癌症比较复杂，microRNA在癌症中的表达谱差别比较大，各阶段、各类型、甚至个体之间也有差别，结论也不完全统一。可以查一下最近microRNA相关的综述,可能会有比较全的介绍

NONCODE DB是一款综合性的数据库，该数据库是一个比较全面的ncRNA相关注释的数据库，尤其是lncRNA信息，不仅支持常用lncRNA的name、NONCODE ID（例如：NONHSAG000001）搜索，部分lncRNA支持其他数据库名字进行搜索。

该数据库目前收入了16个物种，主要是动物方面的，包括人、小鼠、大鼠、奶牛、鸡、果蝇、斑马鱼、线虫、酵母、拟南芥、黑猩猩、大猩猩、恒河猴、复鼠、鸭嘴兽、猩猩。

数据库包含信息丰富，包括表达、功能、与疾病关系、染色体位置、序列保守性等，并可进行序列Blast搜索，同时支持数据下载。目前最新更新为2017年4月6日更新的版本。

数据库的使用

基于这个数据库我们可以浏览所涉及物种的全部lncRNA信息，搜索感兴趣的lncRNA，功能查看，比对，下载等。

1）已知某lncRNA 的序列信息，想知道该lncRNA基因组上位置信息，功能如何？

只需要将序列信息粘贴到blast模块，（参数默认）

2）对于刚刚搜索的比较感兴趣的lncRNA进行功能的注释如下：

只需将lncRNA 的基因ID 输入到Function模块即可。

3）lncRNA的保守性分析：

在concervation模块中输入基因ID即可得到保守性分析树，

解决方法如下：

1，首先，打开string数据库的页面，选择“Multipleproteins”。

2，在第一个框中，粘贴蛋白英文名，呈现出每行一个蛋白的格式，或者点击“Browse”选择包含蛋白名称的excel表格进行上传。

3，粘贴或者上传完毕后，选择“Organism”即输入蛋白的所属物种，可以是人类，大鼠，小鼠等，如果包含多种蛋白，也可以选择“auto-detect”，点击“search”即可。

4，页面会跳转出你输入的蛋白名称以及相匹配的多个蛋白条目，勾选匹配正确的蛋白质，匹配错误的，舍弃即可，继续点击“continue”即可。

5，最终的呈现图案，可以通过下面多个条目进行更改，若要下载，选择“exports”，并选择400bpi高分辨率的条目即可。

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