测序结果如何区分常非编码RNA与mRNA

测序结果如何区分常非编码RNA与mRNA,第1张

非编码RNA(Non-coding

RNA)是指不编码蛋白质的RNA。其中包括rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA

和microRNA

等多种已知功能的

RNA,还包括未知功能的RNA。这些RNA的共同特点是都能从基因组上转录而来,但是不翻译成蛋白。非编码RNA

从长度上来划分可以分为3类:小于50

nt;50

nt到500

nt;大于500

nt。细胞中含量最高的是rRNA

和tRNA

这两种常见的非编码RNA。

而mRNA是由DNA的一条链作为模板转录而来的、携带遗传信息的能指导蛋白质合成的一类单链核糖核酸。

所以说最大的区别在于其序列可不可以编码蛋白质。

同时,如果是原核生物的mRNA

一般有TATAbox的保守序列,如果是真核生物一般-25到-30有TATAbox,-75有CAATbox,再上游有GCbox。这些都是区分mRNA

与非编码RNA的特征。

不过这些工作都需要研究人员通过相应的比对工具逐条筛选和比对,推荐GenBank

数据库,网址是http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/

上面有许多专业的在线分析工具包和全球范围上传的数据可供参考。

ncRNA(non-coding RNA) 就是非编码RNA ,如小分子核仁RNA(sonRNA)、小RNA(miRNA)、小干扰RNA(siRNA)。NcRNA应该是遗传信息的携带者,RNA的一种,目前主要有三大种tRNA|转运RNA,翻译|mRNA信使RNA,转录||rRNA核糖体RNA构成核糖体


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