基因组数据库的GDB数据库

基因组数据库的GDB数据库,第1张

由美国Johns Hopkins大学于1990年建立的GDB是重要的人类基因组数据,由加拿大儿童医院生物信息中心负责管理。

GDB数据库用表格方式给出基因组结构数据,包括基因单位、PCR位点、细胞遗传标记、EST、叠连群(Contig)、重复片段等;并可显示基因组图谱,其中包括细胞遗传图、连锁图、放射杂交图、叠连群图、转录图等;并给出等位基因等基因多态性数据库。此外,GDB数据库还包括了与核酸序列数据库GenBank和EMBL、遗传疾病数据库OMIM、文献摘要数据库MedLine等其它网络信息资源的超文本链接。

GDB数据库是用大型商业软件Sybase数据库管理系统开发的,并用Java语言编写基因图谱显示程序,为用户提供了很好的界面,缺点是传输速度受到一定限制。

GDB数据库是国际合作的成果,其宗旨是为从事基因组研究的生物学家和医护人员提供人类基因组信息资源。其数据来自于世界各国基因组研究的成果,经过注册的用户可以直接向GDB数据库中添加和编辑数据。

1、在arctoolbox里面新建MDB,,再把GDB里面的数据集拖到MDB里面就OK了2、在arctoolbox里面把GDB数据转为SHP格式,,再用FME软件把SHP文件转成MDB关于FME软件,,地学可以去FME论坛看看


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原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/9897912.html

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