1 FTP
FTP是File Transfer Protocol(文件传输协议)的英文简称。在互联网形成之初，非常重要的大文件传输格式。目前NCBI的大文件传输，甚至是整个NCBI网站的数据都可以用这种方式获得。网址为ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/.不过要用好这些数据，你需要同时兼备生物学和计算机科学（基本）知识。
2 网页
当然绝大多数生物学家并不需要进行批量数据分析，知识要找到与自己课题相关的数据。NCBI提供了基于网页的查询检索系统。之所以称之为系统是因为其中包含了NCBI所有提供服务的数据库，该系统有一个统一的查询界面，成为Entrez。其语法和规则在查询不同数据库是基本相似，知识需要简单了解相应数据库的特殊字符即可。例如，查询GEO数据库时，只查询dataset数据可以使用[DataSet Type]关键字，但是该关键字在PUBMED并不适用。
3.web服务
web服务在生物信息学和计算机科学中的定义有很大差别，这里特制计算机科学中的web服务。NCBI基于entrez提供了web service服务，用户在自己的程序中调用代码获取数据。主要是eUtils（http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/）。另外，NCBI也提供cgi的查询服务。
4. 序列查询服务
NCBI基于序列的检索服务是其最具特色的数据检索方式，最著名的就是BLAST。尽管后台算法基于字符串的匹配，但是其引入了生物学知识（突变概率等）使其具有和其他搜索引擎如lucene不可比拟的效果。也是NCBI提供的主要服务之一。BLAST接受用户一条或多条序列（PSI-BLAST），返回数据库中与该序列相似的序列。该服务的用途广泛。
5.其他
有些数据可以通过一些特殊的通道获得。例如GEO数据库，可以通过R包GEOquery获得其数据。
（如有遗漏，敬请指教！）
1、首先GEO数据库是个什么鬼呢？GEO数据库全称GENE EXPRESSION
OMNIBUS，是由美国国立生物技术信息中心NCBI创建并维护的基因表达数据库。它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。
2、那GEO数据库有哪些检索入口呢？
最常用的有两种方式，如果你知道GSE编号可以通过网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo直接进入，具体编号介绍文件下载方法见：https://www.omicsclass.com/article/1100
另外一种就是通过NCBI主页的入口基因搜索下载。通常是不知道GEO编号，通过样品类型，实验处理，平台信息等搜索筛选想要的GEO数据：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/，进入NCBI主页，搜索数据选择GEO DataSets，如果搜索某个基因表达量可选择GEO Profiles。
维普VIPhttp://210.36.19.190/vip/chinese/web/bin/home.htm
http://202.202.96.84:1011/chinese/web/bin/home.htm
http://61.185.237.159:1012/chinese/web/bin/home.htm
http://202.119.47.6/
用户名：njpc
密码：jalis
维普数据库
http://202.202.96.84:1011/chinese/web/bin/home.htm
http://61.185.237.159:1012/
http://202.115.100.8/vip/
用户名：dllg密码：dllg
CNKI
帐号 密码
sycadx sycadx
kj1029 cnkikw
sytp20 sytp20
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sydglg dglg
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CNKI中国优秀博硕士学位论文全文数据库试用
该库收录全国300家博士培养单位的优秀博/硕士学位论文28000篇。收录年限为2000年至今，网上数据库每日更新。
链接地址：http://www.sh.cnki.net/
试用帐号：syshfd，密码：shfd
万方
http://www.wanfangdata.com.cn/
用户:wfglc
密码：gl619
http://www.hepainfo.com/images/lwcx/wanfang.htm
ProQuest数据库的帐号+密码
http://proquest.umi.com/pqdweb
Account = 0DXXJ787DS
Password = welcome
ID:Q79MXW69CK
Password: welcome
医学杂志密码页：
http://168.176.37.84/biblioteca/revistas/medicina.htm
http://www.mmf.gazi.edu.tr/tr/kutuph/elec.html
http://www.lib.umassd.edu/ts/pw/ejournals_pw.html
http://www.portshosp.org.uk/text...yrose.html#Genetics
http://www.ssu.ac.ir/yazd_online_journal_2003.asp[/watermark]
OVID :http://gateway.ovid.com/
Username: calstate
Password: fulltext
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http://gateway-di.ovid.com/
ID:csa999
password:csahosp
Silver Platter:http://web5.silverplatter.com/webspirs/start.ws
Username: csutrial
Password: trials
台湾的电子资料链接，很多免费入口！！！
http://www.lib.pu.edu.tw/database/www/db-essay.htm
可以免费下载多种经典的学术论文，包括了很多SD的文章
http://ideas.repec.org/
springer数据库
http://link.springer.de/
user name: und755bq
password: rjj733un
http://www.medinfofree.com/
http://168.176.37.84/biblioteca/revistas/medicina.htm
医学检索站点
Medical matrix
http://www.medmatrix.org/index.asp
Medical matrix 的使用方法与其他INTERNET信息检索工具的使用方法基本相同，有分类检索和关键词检索两种检索方式。它还提供免费Mailing lists, 只要订阅它的Mailing lists, 即可定期收到网上新增医学节点的通知。
HealthAtoz
http://www.healthatoz.com/
HealthAtoz是一个功能强大的Internet 医学信息资源搜索器。它能对与医学有关的信息进行准确、有效地搜寻。它所收集的信息均经过医学专业人员的人工编辑，以保证搜寻的准确性及方便性。所收集的内容每周更新。可按分类关键词的方式进行检索。
MedExplorer
http://www.medexplorer.com/
MedExporer检索方法与其他网络搜寻器的方法基本相同，主要提供有关医学新闻及杂志的信息。
Medweb
http://www.medwebplus.com/
Medweb收集了非常全面的医药网点的信息，可按关键词查找外，还按医学学科、国家地区将全球医药相关网点进行列表，查询非常方便。
MEL health rescources
http://mel.lib.mi.us/health/health-index.html
Mel health 将INTERNET上的医药信息按学科分类进行整理，提供关键词查找。
Medical Virtual library
http://www.ohsu.edu/cliniweb/wwwvl/
是一个分布式的资源系统，通过这些医药相关虚拟图书馆为起点，通过它与分布在INTERNET上的信息连接，提供关键词查找，并有按字序排列的列表。
MedAll List
http://mcb.harvard.edu/BioLinks.html
Medall是哈佛大学收集医药网点的列表，按字序排列和主题排列，特别是有大量网上医学院校和图书馆的联 结，其检索功能还在建设中。
Pharmweb
http://www.pharmweb.net/
Pharmweb是药学的检索搜寻器，可按检索方向方向（如药学讨论组、新药品等等）进行关键词查找。
Doctor's guide
http://www.docguide.com/dgc.nsf/...545434?OpenDocument
Doctor's Guide是临床医生最大的在线帮助网点，特别提供网上在线报道的医学会议查询。
Clini Web
http://www.ohsu.edu/cliniweb/
Clini Web 是将INTERNET临床信息按MeSH来组织外，还提供SAPHIRE技术通过对疾病临床症状来查询该病的临床资料。
http://www.bilkent.edu.tr/~library/journal.html
中国医院数字图书馆
http://www.chkd.cnki.net/
帐号：liaoning
密码：6503
http://gateway-di.ovid.com/
ID:csa999
password:csahosp
http://www.sciencemag.org/searchall/
http://intl.jbc.org/
http://www.highwire.org/
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化学与化工类
资源名称： AIChE（美国化学工程师协会）
资源地址： http://www.aiche.org/
获取途径： 部分资源可免费查阅
资源名称： American Chemical Society（美国化学学会网站）
资源地址： http://www.chemistry.org/
获取途径： 大部分资源可免费查阅，34种期刊（http://pubs.acs.org/about.html）全部
免费阅览全文。
生物、医学、农业与环境科学
文献型信息资源：
资源名称： EJB（European Journal of Biochemistry欧洲生物化学杂志）
资源地址： http://www.ejbiochem.org/、http://intl.ejbiochem.org/
获取途径： 通过网络直接获得EJB全文和服务，EJB的检索页面还链接了334种与生物化学相关的专业期刊，可供免费检索。
资源名称： PubMed
资源地址： http://www.ncbi.nim.nih.gov/PubMed/
获取途径： 直接登录网站访问PubMed。提供免费MEDLINE等数据库检索，并提供部分付费全文链接服务。
资源名称： NCBI（美国国家生物技术信息中心）
资源地址： http://www.ncbi.nim.nih.gov/
获取途径： 大部分的期刊全文是可以获取的，NCBI上的基因序列库等生物信息也都是免费检索和获取的。
专业信息门户：
资源名称： 生命科学学科信息门户
资源地址： http://202.127.20.12:10000/
获取途径： 通过网络直接进入该网站
综合
文献型信息资源：
资源名称： NSTL网络服务系统
资源地址： http://www.nstl.gov.cn/
获取途径： 全国所有互联网用户。系统提供的文献检索和网络版全文文献阅览、下载服务一律免费，全文提供服务仅收取少量成本费（0.5元/页），申请全文服务的用户必须是注册用户。
资源名称： Springer Link（施普林格在线图书馆）
资源地址： http://link.springer-ny.com/
获取途径： 通过Springer Link可以免费查阅文摘和全文。
资源名称： The National Academies Press（NAP）
资源地址： http://www.nap.edu/、http://www.jhpress.org/
获取途径： 在NAP主页上可免费网上阅览2500多种电子图书。
资源名称： 联合西文期刊篇名目次库
资源地址： http://159.226.100.9/cur_cont/default.asp、http://www.nlc.gov.cn
获取途径： 全国范围内的读者可通过上述网址，进行篇名检索、期刊检索。
资源名称： 中国科学文献数据库
资源地址： http://159.226.100.50/cgrs/
获取途径： 可通过网络自由查询使用，没有任何限制。
资源名称： 中国科学院图书馆馆藏西文文献数据库
资源地址： http://docdb.las.ac.cn/cgrs/
获取途径： 可通过网络自由查询使用，没有任何限制。
资源名称： 中国科学院学位论文数据库
资源地址： http://docdb.las.ac.cn/cgrs/
获取途径： 可通过网络自由查询使用，没有任何限制。
资源名称： 中西日俄文联合目录数据库
资源地址： http://159.226.100.50/catalog/default.html
获取途径： 可免费检索，部分论文可提供全文。
专业信息门户：
资源名称： NDLTD（Networked Digital Library of Theses and Dissertations）
资源地址： http://www.theses.org/
获取途径： 可免费获得论文的题录和详细摘要。
全文电子期刊：
资源名称： Cambridge Journals Online
资源地址： http://journals.cambridge.org/
获取途径： 可免费获得文摘，刊名后有FREE标记的期刊可免费阅读全文。
资源名称： HighWire Press
资源地址： http://intl.highwire.org/
获取途径： 按字母顺序浏览刊名时，刊名后标注位"Free issues"的期刊可以免费获得过刊的全文，时间从3个月前到两年前，各刊情况不同。标注为"Free Trial"的期刊可以在试用期内获得全文。标注为"Free site"的期刊可以获得所有全文。
资源名称： Elsevier SDOS（ScienceDirect OnSite）
资源地址： http://www.sciencedirect.com/
获取途径： 我所已开通在线服务，可提供1500多种电子期刊全文数据库，其中生命科学339种。
资源名称： Science Online（科学在线）
资源地址： http://china.sciencemag.org/
获取途径： 中国服务器免费提供服务
资源名称： 中国科技期刊数据库
资源地址： http://159.226.100.28/
获取途径： 先下载浏览器，在"用户登录"处按"登录"然后进入"中国科技期刊全文数据库"即可查阅全文。
以下期刊网址：http://annualreviews.org/看文摘
1. Annual Review of Biochemistry
2. Annual Review of Biophysics &Biomolecular Structure
3. Annual Review of Cell &Developmental Biology
4. Annual Review of Genetics
5. Annual Review of Immunology
6. Annual Review of Microbiology
7. Annual Review of Neuroscience
以下期刊网址： 到图书馆查阅
8. Acta Crystallography Section A
9. Acta Crystallography Section D
以下期刊网址：http://www.sciencedirect.com/看全文
10. Biochemical and Biophysical Research Communications
11. C.O. Biotechnology
12. C.O. cell Biology
13. C.O. Genetics &Development
14. C.O. Immunology
15. C.O. Neurobiology
16. C.O. Structural Biology
17. Cell
18. Cellular Signalling
19. Chemistry &Biology
20. Current Advances in Protein Biochemistry
21. Current Biology
22. Free Radical Biology &Medicine
23. International Journal of Biological Macromolecules
24. Journal of Molecular Biology
25. Journal of Structure Biology
26. Neural Networks
27. Neuron
28. Structure
29. Trends in Biotechnology
30. Trends in Neuroscience
以下期刊网址：http://pubs.acs.org/看全文
31. Biochemistry
32. Journal of American Chemical Society
33. The Journal of Physical Chemistry
以下期刊网址：http://periodical.cnpeak.com/看全文
34. Bioinformatics
35. Molecular Membrane Biology
36. Nucleic Acids Research
37. Protein Engineering
38. Visual Neuroscience
以下期刊网址：http://www.interscience.wiley.com/看文摘院馆有Online
39. Biotechnology and Bioengineering
40. Cell Biochemistry and Function
41. Proteins
以下期刊网址：http://www.biophysj.org/看一年前的全文
42. Biophysical Journal
以下期刊网址：http://www.biochemj.org/看文摘院馆有Online
43. The Biochemical Journal
以下期刊网址：http://content.karger.com/ProdukteDB/看文摘可看部分全文
44. Brain Behavior and Evolution
以下期刊网址：http://cancerres.aacrjournals.org/看文摘院馆有Online
45. Cancer Research
以下期刊网址：http://intl.clinchem.org/
46. Clinical Chemistry
以下期刊网址：http://www.liebertonline.com/看文摘院馆有Online
47. DNA and Cell Biology
以下期刊网址：http://emboj.oupjournals.org/看全文到图书馆查阅
48. The EMBO Journal
以下期刊网址：http://www.nature.com/embor/看全文
49. EMBO Report
以下期刊网址：http://www.ejbiochem.org/看全文
50. European Journal of Biochemistry
以下期刊网址：http://www.blackwellpublishing.com/journals/ejn/看文摘
51. European Journal of Neuroscience
以下期刊网址：http://www.fasebj.org/看一年前的全文
52. The FASEB Journal
以下期刊网址：http://www.tandf.co.uk/journals/online.html看文摘
53. Free Radical Research
以下期刊网址：http://www.genome.org/看一年前全文
54. Genome Research
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55. JAMA:Journal of American Medical Association
以下期刊网址：http://www.jbc.org/看文摘院馆有Online
56. Journal of Biological Chemistry
以下期刊网址：http://journals.kluweronline.com/看文摘
57. Journal of Biomolecular NMR
以下期刊网址：http://www.jcb.org/看一年前的全文
58. The Journal of Cell Biology
以下期刊网址：http://www.biologists.com/
59. Journal of Cell Science 看全文
60. Development 看一年前全文
以下期刊网址：http://jn.physiology.org/看文摘院馆有Online
61. Journal of Neurophysiology
以下期刊网址：http://www.jneurosci.org/看文摘
62. Journal of Neuroscience
以下期刊网址：http://www.learnmem.org/看文摘
63. Learning &Memory
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64. Molecular and Cellular Biology
以下期刊网址：http://springer.lib.tsinghua.edu.cn/清华镜像站看全文
65. Molecular Genetics and Genomics
以下期刊网址：http://www.nature.com/看全文到图书馆查阅
66. Nature
以下期刊网址：http://www.nature.com/nrm/#看全文
67. Nature Review Molecular Cell Biology
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68. Nature: Biotechnology
以下期刊网址： http://www.nature.com/ncb/看全文
69. Nature: Cell Biology
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70. Nature: Genetics
以下期刊网址：http://www.nature.com/nm/看全文
71. Nature:Medicine
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72. Nature: Neuroscience
以下期刊网址：http://www.nature.com/nsb/看全文
73. Nature: Structural Biology
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74. P.N.A.S.
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75. Perspectives in Biology and Medicine
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76. Physiological Reviews
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77. Photochemistry &Photobiology
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78. Protein and Peptide Letters
以下期刊网址：http://www.proteinscience.org/看文摘
79. Protein Science
以下期刊网址：http://intl.sciencemag.org/看全文
80. Science
以下期刊网址：http://www.sciam.com/看全文
81. Scientific American
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