怎样使用NCBI搜索并下载基因序列

工具/材料

NCBI官网

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首先，我们打开NCBI官网页面，在页面上方搜索框中，选择要下载的基因序列类别，这里我们需要选择“Nucleotide”选项。

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接下来，我们就需要输入具体的名称了，这里我输入的是Kinase，代表一种酶，然后点击“search”按钮，即可出现搜索结果。

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点击进入所需要的搜索结果，在页面中左侧，点击“FASTA”按钮。

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在接下来打开的页面右侧，点击“Send to”选项，然后选择“File”，点击“Creat File”按钮。

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最后，我们即可调用浏览器下载该基因序列文件了，选择好文件存储位置之后，点击“下载”按钮。

NCBI是National Center for Biotechnology Information的缩写，指美国国家生物技术信息中心，建立于1988年。

NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统。除了建有GenBank核酸序列数据库（该数据库的数据资源来自全球几大DNA数据库，其中包括日本DNA数据库DDBJ、欧洲分子生物学实验室数据库EMBL以及其它几个知名科研机构）之外，NCBI还可以提供众多功能强大的数据检索与分析工具。

扩展资料：

NCBI提供的资源有Entrez、Entrez Programming Utilities、My NCBI、PubMed、PubMed Central、Entrez Gene、NCBI Taxonomy Browser、BLAST、BLAST Link (BLink)、Electronic PCR等共计36种功能，而且都可以在NCBI的主页www.ncbi.nlm.nih.gov上找到相应链接，其中多半是由BLAST功能发展而来的。

已故参议员克劳德·佩珀认识到计算机化信息处理方法对于进行生物医学研究的重要性以及赞助立法，该立法于1988年11月4日成立了国家生物技术信息中心（NCBI），作为国家医学图书馆的一个部门（NLM） ）在美国国立卫生研究院（NIH）。

参考资料来源：

百度百科-NCBI

向GenBank提交数据

提交序列有两种方式，一个是在线的页面提交序列bankit，另一个是通过NCBI的Sequin软件提交序列。

从使用方便性上来说，两者均需要填写所必须的各项资料，也都是很麻烦，但后者也以同时提交多项序列，而且不会因为网络错误而导致已填写的数据丢失，还是更有利一些。

使用起来都是比较简单的，按照页面或者软件的说明一步一步填写即可。

提交序列后，系统会暂时给你分配一个临时的序列号，等到你的序列经过初步审核后会得到正式的Genbank序列号或登录号。你可以对你的序列随时进行修改和补充其他相关资料。

· 关于提交序列数据，收到 accession number，和对纪录作更新的一般信息。

· BankIt - 用于一条或者少数条提交的基于WWW的提交工具软件。（请在提交前用 VecScreen 去除载体）

· Sequin - 提交软件程序，用于一条或者很多条的提交，长序列，完整基因组，alignments，人群/种系/突变研究的提交。可以独立使用，或者用基于TCP/IP的"network aware"模式，可以链接到其他NCBI的资源和软件比如Entrez和PowerBLAST。（请在提交前用VecScreen去除载体）

· ESTs - 表达序列标签，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列。也包括来自于差异显示和 RACE 实验的 cDNA 序列。

· GSSs - 基因组调查序列，短的、单次（测序）阅读的cDNA序列，exon trap 获得的序列，cosmid/BAC/YAC 末端，及其他。

· HTGs - 来自于大规模测序中心的高通量基因组序列，未完成的（阶段0，1，2）和完成的（阶段3）序列。（注意：完成的人类的HTG序列可以同时在 GenBank 和 Human Genome Sequencing页面上访问。）

· STSs - 序列标签位点。短的在基因组上可以被唯一 *** 作的序列，用于产生作图位点。

注：SNPs - 人类的和其他物种的遗传变异数据可以提交到NCBI数据库的单核苷酸多态性库中（dbSNP）

）先登陆：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html

2)收到邮件，编辑，提交序列。

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