简述pubmed数据库中高级检索的步骤及方法

简述pubmed数据库中高级检索的步骤及方法,第1张

步骤:

打开电脑上的浏览器,然后再浏览器地址界面里输入百度主页的地址(当然,如果大家能够将Pubmed数据库的网址默写出来也可以直接将地址输入到浏览器地址框里),因为这里不允许贴地址,所以就不放地址出来,大家按照后面流程获取。

在百度搜索框里输入Pubmed关键词,然后点击搜索按钮进行搜索,这里就可以看见搜索结果的前几个网站就是Pubmed网站的地址。

选择一个网站进入,然后进入到Pubmed网站主页,点击搜索框下面的Advance按钮进入到高级搜索界面。

进入高级搜索界面之后,点击搜索界面的All filed选择搜索范围,可以选择各种各样的范围进行搜索。

小编这里选择title和Date两个范围进行搜索,在title后面的输入框里输入想要搜索的文献的关键词,第二行选择文献发表的时间,这里如果需要更多的范围限制的话,可以点击第二行后面的+号按钮添加搜索范围限制。

在搜索框里填写关键词的同时,上面的搜索框里会将整个搜索表达式展示出来,我这里显示的是:(IT[Title]) AND ("2014"[Date - Publication] : "3000"[Date - Publication])

完成上述步骤之后,然后点击下面的Search按钮展示出搜索结果。

跳转到搜索结果界面,在搜索框里展示了刚刚出现的检索表达式,下面就是搜索出来的文献。

PubMed 是一个免费的搜寻引擎,提供生物医学方面的论文搜寻以及摘要的数据库。它的数据库来源为MEDLINE。其核心主题为医学,但亦包括其他与医学相关的领域,像是护理学或者其他健康学科。它同时也提供对于相关生物医学资讯上相当全面的资源,像是生化学与细胞生物学。该搜寻引擎是由美国国立医学图书馆提供,作为 Entrez 资讯检索系统的一部分。PubMed 的资讯并不包括期刊论文的全文,但可能提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。

PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据,3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线,也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。

1.打开KEGG数据库首页,链接如下:http://www.genome.jp/kegg/,如下所示:

点击“KEGG PATHWAY”字样链接,可见如下界面:

一直往下看,会发现KEGG数据针对pathway做了分类,主要包含Metabolism、Genetic Information Processing、Environmental Information Processing、Cellular Process、Organismal Systems、Human Diseases、Drug Development七个方向,并针对每个方向还有更为细致的分类,例如Metabolism包含Carbohydratemetabolism、Energy metabolism、Lipid metabolism等,各位看官可以根据您的研究方向或感兴趣通路选择具体的pathway进行查看。

2.假如我们关注Carbohydrate metabolism下的Pentose phosphate pathway,点击后获得如下界面:

其中最上面的Reference pathway表示我们目前查看的通路是所有物种通用的pathway,下面的一段文字是对这个pathway的介绍,再下面网络图显示此pathway具体信息。

其中带有Pentosephosphate pathway字样的方框点击开可发现对这个通路的其他信息介绍,同时可看到这个通路的ID(map00030),这个用map开头+数字组成的ID表示所有物种通用的通路ID,如果是某一特定物种的ID,会以该物种的3个字母简写名字+数字组成,例如hsa00030。在网络图中方框表示的是参与反应的酶,例如1.1.1.47,这是酶的ECnumber,国际酶学委员会赋予的编号。

小圆圈表示化学反应中的化合物,例如beta-D-Glucose(C00221)。箭头代表的是反应方向,虚线表示此反应可以通过中间产物或其中途径发生联系。大椭圆表示与此通路相关的另一个pathway。如果您想要只关注human的Pentose phosphate pathway,就可以在Reference pathway处进行选择,之后点击Go即可。

这个时候您会发现在第一行显示与不选择物种时有一定区别,会标记为human信息,同时点击网络图中的带有Pentose phosphate pathway的方框,里面会有human的这个通路的信息,包含了human该通路的pathway ID(hsa00030)和介绍。

网络图本身也有变化,部分方框为浅绿色,其他不变。其中浅绿色方框为人类含有的酶,例如3.1.1.17,把鼠标放在上面会有相关信息显示。白色方框的酶在人类中不含有,把鼠标放在上面不会有任何信息显示。

浅绿色方框可以点击开查看详细信息,例如点击3.1.1.17,获得如下界面,Entry为该酶在KEGG数据库中的ID,Gene name为此酶的简化名,Difinition为此酶的通用名字EC number,KO是在KEGG数据库中该酶的同源序列号,Pathway中罗列出了该酶参与的通路,除此之外,还显示很多其他信息,例如编码该酶的三级结构(Structure)、基因序列(NT seq)和氨基酸序列(AA seq)等信息。

注意哦,上图的右上角,有一个Help字样,如果您对此页面中信息不清楚,可以点击Help,页面里对每项都有相应的详细介绍。

如果您知道自己关注通路的ID,可以直接在第一步的基础上直接搜索,也可以获得特定物种的通路信息,例如上面的human的Pentosephosphate pathway,ID为hsa00030,我们就可以直接用这个ID进行搜索,具体 *** 作为在步骤1的第二幅图中填入ID号,选择物种has,点击Go即可,页面如下:

在出现的页面中,点击hsa00030这个通路即可。

电子商务源于英文(ELECTRONICCOMMERCE),简写为EC。

顾名思义,其内容包含两个方面,一是电子方式,二是商贸活动,EC(电子商务)指的是利用简单、快捷、低成本的电子通讯方式,买卖双方不谋面地进行各种商贸活动。

电子商务可以通过多种电子通讯方式来完成。

另一种说法是:EC电子罗盘(ElectricalCompass,EC)可通过对地球磁场等信息的读取、计算,精确输出载体的航向角和俯仰角等姿态角参数。

EC具有体积小、成本低等优点,航向精度较高,是常用的航向测量设备,被广泛的应用于各种工业仪表和导航系统中。


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原文地址: http://outofmemory.cn/sjk/9965306.html

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