转录因子结合位点预测strand-1什么意思

可以预测Transcription factor binding site的数据库有：1.用Jasparhttp://jaspar.genereg.net/2.用PROMO http://alggen.lsi.upc.es/cgi-bin/promo_v3/promo/promoinit.cgi?dirDB=TF_8.33.用TFSEARCH（据说用的是TRANSFAC很旧的数据库） http://www.cbrc.jp/research/db/TFSEARCH.html4.用商业数据库TRANSFAC（要付费） http://www.gene-regulation.com/pub/databases.html/

strand-specific这个翻译成链特异性，链特异性RNA-Seq分析，链特异性就是因为建库测序时mRNA反转录为双链cDNA文库，可以确定转录本来自正链还是负链，更好的准确度获取基因结构。具体说就是在建库合成第二链cDNA时吧dTTP换成dUTP然后加上接头，降级第二链

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