生物学数据库都有哪些

分子生物学数据库大全：核酸数据库、基因表达数据库、蛋白数据库、糖数据库、专利数据库等国际顶尖数据库列表可以在生物帮那里找到的，我一般找资料，最新资讯都是到那里的，他们比较专业，权威，也比较全面，技术文档，视频，产品都蛮丰富的。年来大量生物学实验的数据积累，形成了当前数以百计的生物信息数据库。它们各自按一定的目标收集和整理生物学实验数据，并提供相关的数据查询、数据处理的服务。

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

1、UniProt数据库

蛋白组学常用数据库UniProt（全称UniProt Protein Resource），建立于1986年，由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的，其信息量丰富、资源广泛，是目前公认的首选免费蛋白质数据库。

2、The Human Protein Atlas数据库

The Human Protein Atlas内含近30000种人类蛋白质的组织和细胞分布信息，并提供免费查询。

瑞典Knut&Alice Wallenberg基金会利用免疫组化技术，检查每一种蛋白质在人类48种正常组织，20种肿瘤组织，47个细胞系和12种血液细胞内的分布和表达，其结果用至少576张免疫组化染色图表示，并经专业人员校对和标引，保证染色结果具有充分的代表性。

3、PhosphoSitePlus数据库

PhosphoSitePlus数据库是一个由CST和NIH联合开发的免费资源数据库，总结归纳了海量通过科学研究发现的蛋白修饰位点，包括磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化等，并且包括一些CST公司发现但未发表的蛋白修饰位点。

该数据库是动态的、开放的、高度互动并持续更新的。它有助于研究PTMs在正常和病理细胞/组织中的作用，同时它也是发现新的疾病标志物和药物靶点的有力工具。

性能及历史

蛋白质数据库（HPDB），建于2005年5月，动态展示生物大分子立体结构，鼠标点击放大分子结构、原子定位、测定原子之间距离，可用于教学或科研。服务对象是能够熟练使用中文的生命科学、医学、药学、农学、林学等领域的大中专学生、教师及科技工作者。

分子结构特征描述采用汉语，同时提供英文原文以供考证。对于善于使用英文的读者，我们提倡直接访问RCSB PDB，一来可以减少网络拥挤，二来可以减少由于HPDB的翻译不妥带来的不便。

蛋白质数据库（HPDB）对每个蛋白质分子结构说明部分做了中文翻译（最新加入数据库的分子除外），内容包括分子结构定性描述、样品的来源、表达载体、宿主、化学分析方法、分子结构组成成分等。这些信息并同蛋白质分子结构数据存储于数据库，因此HPDB支持中文查询。

蛋白质数据库（HPDB）虽然翻译了“分子结构说明”部分，但为了保证数据的可靠性和准确性，HPDB对一级结构序列及大分子结构坐标数据等未做任何改动，数据库保持RCSB PDB核实后的原始实验数据文件，并保持PDB文件格式和蛋白质分子编号。

一 美国国家生物技术信息中心NCBI(National Center for

Biotechnology Information)

NCBI是一个极具人性化的网站,网站的主页清晰的阐明了NCBI所做的工作及相关领域最新的热点内容，新闻等。为了方便使用者更加熟练使用网站资源，NCBI在主页清晰的标注了站点导航，非常便于初学者熟悉和掌握NCBI的站内资源。

另外，NCBI将其网站资源列于主页左侧，其中包括：SITE MAP, About NCBI, GenBank, Literature

databases, Molecular databases, Genomic biology, Tools, Research at

NCBI, Software engineering, Education, FTP site, Contact

information等等。

二EBI(European

Bioinformatics Institute)欧洲生物信息研究所The European

Bioinformatics Institute（EBI）是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一，位置座落于英国The Wellcome Trust

Genome Campus。EBI的任务就是确保分子生物与基因体的研究信息可以公开并且免费提供给科学社群，以促进科学进步。

EBI所提供的服务包括建立/维护数据库、提供分子生物相关信息服务、执行分子生物与计算分子生物研究；所服务的对象与研究人员扩及各产业，包括分子生物、基因体、医学与农业学术研究、农业、生物技术、化学与制药工业。

三DDBJ(DNA　Data Bank of

Japan)日本核酸数据库

DDBJ(DNA Data Bank of Japan)

设立在日本国家遗传研究所（NIG），于1986年开始DNA数据库的构建工作。从一开始，DDBJ就作为国际性DNA数据库之一，发挥着重要的作用。它

首先反映的是日本国内数据库的资源，并与NCBI,EBI进行频繁的国际性合作。DNA序列中蕴含了大量的数据资源，比起其它生物学数据，它在阐述进化方面的作用更为直接。因此，探求DNA数据库，不仅是在生命科学方面的研究，更是为人类的发展谋福利。

DDBJ是日本唯一的DNA数据库，它从研究者那里收集DNA 序列并且给数据提交者一个国际公认的编码。DDBJ

主要从日本研究者那里收集数据，当然，它也接受外国研究者的数据并给以编码。

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