在【对象资源管理器】窗口中展开服务器,然后选择【数据库】节点
右键单击【数据库】节点,从d出来的快捷菜单中选择【新建数据库】命令。
执行上述 *** 作后,会d出【新建数据库】对话框。在对话框、左侧有3个选项,分别是【常规】、【选项】和【文件组】。完成这三个选项中的设置会后,就完成了数据库的创建工作,
在【数据库名称】文本框中输入要新建数据库的名称。例如,这里以“新建的数据库”。
在【所有者】文本框中输入新建数据库的所有者,如sa。根据数据库的使用情况,选择启用或者禁用【使用全文索引】复选框。
在【数据库文件】列表中包括两行,一行是数据库文件,而另一行是日记文件。通过单击下面的【添加】、【删除】按钮添加或删除数据库文件。
切换到【选项页】、在这里可以设置数据库的排序规则、恢复模式、兼容级别和其他属性。
切换到【文件组】页,在这里可以添加或删除文件组。
完成以上 *** 作后,单击【确定】按钮关闭【新建数据库】对话框。至此“新建的数据”数据库创建成功。新建的数据库可以再【对象资源管理器】窗口看到。
肿瘤基因组图谱 (TCGA) 计划由美国 National Cancer Institute(NCI) 和 National Human Genome Research Institute(NHGRI)于 2006 年联合启动的项目,目前共计研究 36 种癌症类型。
TCGA 利用大规模测序为主的基因组分析技术,通过广泛的合作,理解癌症的分子机制。提高人们对癌症发病分子基础的科学认识及提高我们诊断、治疗和预防癌症的能力。 最终完成一套完整的与所有癌症基因组改变相关的「图谱」。
TCGA临床数据有两种:
数据文件有 (HTSeq count/ FPKM/ FPKM-UQ)3种
介绍链接
生成raw read counts数据记录==在mirnas.quantification.txt==文件中。多比对用cross-mapped列标注。文件中包括associates miRNA IDs with read count and a normalized count in reads-per-million-miRNA-mapped。
RPM counts记录在 ==isoforms==.quantification.txt文件中。文件中包括miRNA表达量定量分析中的所有列,除此之外还增加了isoforms的基因组坐标信息以及miRNA信息(前体或成熟&accession)
使用Affymetrix SNP 6.0芯片,基于TCGA level 2 数据,最终生成txt文件,包含5列(片段名称,染色体,基因组位置,结合到芯片上的探针数量,seqment_mean)
包括以下几个平台:
文件包括以下这些列:
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