为什么之前在HMDB数据库搜到的数据找不到了

为什么之前在HMDB数据库搜到的数据找不到了,第1张

你好,这个可能是sql服务没开启导致在HMDB的数据库中搜不到数据了。 所以建议先进服务,开启该服务。 如果还是无法开启,就将把系统时间往前退几天,再启动服务试试。人类代谢组数据库(HMDB)于2007年首次发布,被认为是人类代谢研究的标准代谢组学资源,包含有关人类代谢物及其生物学作用、生理浓度、疾病相关性、化学反应、代谢途径和参考光谱的综合信息。HMDB包含114222个代谢物条目,包括水溶性和脂溶性代谢物以及被视为丰富(>1μm)或相对罕见(<1nm)的代谢物。

代谢通路:目前在通路数据库(PATHWAY database) 中代谢通路是建立得最好的,有大约90个参考代谢途径的图形。每个参考代谢途径是一个由酶或EC号组成的网络。

利用如下方法可通过计算机构建出生物体特有 的代谢通路:

先根据基因的序列相似性和位置相关性确定基因组中酶的基因。

然后合理地安排EC号。

最后将基因组中的基因和参照通路中用EC号编号的基因产物 结合起来。


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