测序fq文件的Q20是什么意思

Q20值是指的测序过程碱基识别（Base Calling）过程中，对所识别的碱基给出的错误概率。

如果质量值是Q20，则错误识别的概率是1%，即错误率1%，或者正确率是99%；

如果质量值是Q30，则错误识别的概率是0.1%，即错误率0.1%，或者正确率是99.9%；

如果质量值是Q40，则错误识别的概率是0.01%，即错误率0.01%，或者正确率是99.99%；

你发现规律没有，Q“N”0的质量值，就是正确率有N个9的百分比，这样就非常容易记忆了。

格式的文件

中华大测序仪由于采用无模式测序技术，不会生成FQ格式的文件，而是生成了csfasta和qual文件。csfasta文件包含测序的序列信息，而qual文件则是用来记录每个碱基的质量值的。

---