高斯输出文件的关键是看Link,每个Link对应不同的部分,以单点计算为例:单点计算的流程。
输入行在#后加入P,不然的话就只会显示Link 1和0,输出文件一般很长。对于单点计算,只有300多行。
第一部分:
基本运行信息
输入输出文件名,初始命令
进入Link 1,显示进程号
首先是版权说明,
然后是作者,利用guassian计算所发的文章,参考文献上必须列的
进入
Link 101
读入输入文件,
将控制命令转化为程序能够看得懂的IOP占位段的选项和应用设置
Leave Link 101
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Link 202:
判断体系对称性,并决定实际计算中对称性应该如何利用
判断体系点群
例如
StoichiometryCH2O
Framework group C2V[C2(CO),SGV(H2)]
Deg. of freedom3
Full point groupC2VNOp 4
Largest Abelian subgroup C2VNOp 4
Largest concise Abelian subgroup C2 NOp 2
再将输入的分子坐标转换为标准内坐标, 就是
Standard orientation:
这是程序默认,充分利用分子的对称性来达到方便计算的目的。就是将体系的质量中心放在坐标轴的主轴或者原点上。可以用nosym来禁止这个 *** 作
Leave Link 202
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Link 301 产生基组信息
基组函数对称性
计算出核排斥能
Leave Link 301
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Link 302,303 ,这部分是计算积分的具体算法,一般不会列出详细过程,一句话带过
leave Link302,303
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Link 401 在实际计算之前,必须有初始猜测,这部分的功能就是产生初始猜测,可以从chk文件读入,也可以程序自动产生。这部分可以用guess关键字来指定。
我这个体系,程序默认是:
Projected INDO Guess(请仔细看手册,不同的体系Guess是不一样的)
Leave Link 401
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Link 502 (主角登场!)自恰迭代求解SCF方程
设定收敛标准:
除了对包含比Ar重的原子的分子全电子(非ECP)计算外,积分只计算到10-6的精度。l
SCF计算的能量和电子密度都收敛到10-4,或只有能量收敛到10-5为止,无论哪一个先达到。l
给出每一步迭代的信息(?)(这只有在程序输入中加入#p才会显示)
如果成功计算完毕
SCF Done,接下来就是打印计算出来的能量,自旋,维力值和收敛判据了.
Leave Link502(一般计算经常会在这一步挂掉,哈哈)
如果你的单点计算只写了这些,输出结束,如果你加入了population的内容,那么,基于scf计算的结果,布局分析开始
进入Link601
Link 601 利用优化后的波函数,
进行Mulliken population,得到
轨道对称性
电子态
各个轨道的本征值
然后是一些电荷,自旋密度的分析
leav Link601
最后是整个计算结果的一个总结,各小节之间用\分开
单点计算看明白之后看几何优化的就比较清楚了
同时打开你的输入文件和输出文件,比较一下,看你的输出文件是否是你所想要的,如果是,你可以改动一下输出文件的键长,键角,或者是二面角,然后将输出文件重新保存为输入文件。如果输出文件不是你想要的,那就只能重新构建输入文件!scf优化可以认为是对指定结构的波函数不断优化的过程,是为了找到某个指定结构下能量最低的波函数,而几何构型优化是对结构的优化的过程,是为了找到势能面上的某个能量极小结构一次构型优化,需要多次scf优化才能最终完成
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