http://loci.wisc.edu/software/bio-formats
这个软逗携件可以枯让打开
http://loci.wisc.edu/bio-formats-format/eps-encapsulated-postscript
目前市场有很多流式仪器,包括几家大的公司如BD,贝克曼等。FlowJo做为一款优秀的流厅禅式数据分析软件,可以兼容几乎所有流式仪器采集的数据,可以弥补其它机器自带软件的分析功能不足的缺憾,这也是FlowJo备受欢迎及推崇的原因。今天将详细介绍如何用FlowJo来分析BD公司的机器Accuri C6采集的数据。Accuri C6是一款全功能、双激光的小型桌面流式细胞仪,有其独特的优势。但是Accuri C6自带的CFlow软件在分析流式数据方面还存在一些进步的空间,比如:缺乏完善的图片叠加功能,尤其是其直方图叠加的效果有待加强;缺乏细胞周期分析工具、增殖分析工具以及动力学分析工具。FlowJo是目前直接可以和它兼容的流式数据分析专业软件,满足用户的数据分析要求。
实际上,用FlowJo分析Accuri C6的流式数据与用FlowJo分析其他流式细胞仪采集的流式数据是一样的。只不过由拆伏核于Accuri C6在采集数据的时候不需要设置电压等特点,在分析Accuri C6数据的时候要做一些简单的处理。这篇博文将对这些处理步骤做详细的介绍。
一、在Accuri C6将数据导出为FCS格式
ISAC制定的流式数据的标准格式为FCS格式,Accuri C6的CFlow软件默认的数据保存格式为其特有的C6格式。因此,在用FlowJo分析Accuri C6数据之前,需要将数据转换为FCS格式。可参考下面的 *** 作步骤:
1.打开CFlow软件,点击File菜单,在下拉菜单中选择Open CFlow File or Template,导入采集到的C6格式的数据
2.点击File菜单,在下拉菜单中选择Export FCS File或者Export ALL Sample as FCS
二者的区别是:
Export FCS File:将选定旅掘的某个data well (sample) 输出为FCS格式的数据,并保存到用户自建的文件夹里
Export ALL Sample as FCS:将所有的data well (sample) 输出为FCS格式的数据,并保存到“CFlow-FCSExports”文件夹里,这个文件夹一般在桌面上
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